Presentació
La Unitat de Genòmica Clínica (UGC) forma part del Servei de Genètica de l'Hospital Germans Trias (HUGTiP) de l'àrea Metropolitana Nord de Barcelona. El grup de recerca té diverses responsabilitats importants, com facilitar diagnòstic i seguiment als pacients amb malalties hereditàries, brindar assessorament genètic als pacients i als seus familiars, i realitzar proves genètiques per a determinar la causa genètica d'aquestes malalties. El grup es dedica a millorar l'atenció al pacient tenint en compte tots els aspectes de l'atenció al pacient: emocionals, socials, religiosos i físics.
El grup també es centra en augmentar la rendibilitat de les proves genètiques i ampliar els seus coneixements sobre les bases genètiques de diverses malalties, tant monogèniques com poligèniques. A fi d'aconseguir aquest objectiu, estan desenvolupant de manera activa noves tècniques genòmiques per a analitzar les variants somàtiques i de la línia germinal tant en l'ARN com en l'ADN, i també estan posant en pràctica una nova tecnologia per al genotipat massiu a fi d'establir noves puntuacions de risc poligènic. A més, el grup està participant en el desenvolupament de nous mètodes per a determinar la presència i concentració de biomarcadors farmacogenòmics establerts mitjançant la participació en PHARMA-IMPCAT i la creació de la Unitat de Farmacogenòmica a l'HUGTiP.
A més, el grup és membre del Centre de Referència Espanyol (CSUR) per a pacients adults amb facomatosi (neurofibromatosi, schwannomatosi, esclerosi tuberosa i malalties de Von-Hippel Lindau), que forma part de GENTURIS, una Xarxa Europea de Referència (RER). El grup està treballant en el desenvolupament d'estratègies de medicina personalitzada per a aquest grup de pacients i en el desenvolupament de noves directrius clíniques que també tinguin en compte les necessitats emocionals i socials d'aquests pacients. També estan descobrint nous biomarcadors pronòstics i establint el paper de les alteracions genòmiques en el desenvolupament de lesions associades a aquestes malalties, així com posant en pràctica diverses estratègies de teràpia gènica per a curar aquestes malalties.
Paraules clau: neurofibromatosi, schwannomatosi, proves genètiques, genòmica clínica, genètica clínica, teràpia gènica, facomatosi, malalties rares.
Líder/s de grup
- Ignacio Blanco Guillermo
Ignacio Blanco Guillermo
Ignacio Blanco és el coordinador d'una CSUR (unitat de referència) del Sistema Nacional de Saludi el coordinador nacional de la European Network of Reference Centers (ERN) GENTURIS, una xarxa per a tots els pacients amb qualsevol dels síndromes rars de predisposició genètica al desenvolupament de tumors (GENTURIS). A més, és membre del Comitè Assessor en Malalties Minoritàries (CAMM) del Govern de Catalunya i assessor del Ministerio de Sanidad en l'àrea de Genètica.
Contacte: iblanco.germanstrias(ELIMINAR)@gencat.cat
ORCID: 0000-0002-7414-7481Biografia ampliada (narrada pel Dr. Blanco):
El 2009 em vaig incorporar a l'Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP) per encarregar-me de l'activitat de diagnòstic genètic del programa de Càncer Hereditari. Des de 2015, sóc el coordinador del diagnòstic genètic en el Centre de Referència Espanyol (CSUR) en Facomatosi. En els darrers anys, el nostre grup s'ha incorporat a GENTURIS (Xarxa Europea de Referència en síndromes de risc tumoral genètic rar) i ha estat reconegut com a grup consolidat de Neurofibromatosi per la Generalitat de Catalunya (SGR2018, SGR2022). També participo en el programa XIGENICS de l'Institut Català de la Salut i col·laboro estretament amb l'Institut Català d'Oncologia (ICO) i la Dra. Lázaro.
Durant el període 2009-2019, vaig desenvolupar tota la meva activitat de diagnòstic, innovació i recerca dins del Grup de Càncer Hereditari, liderat per la Dra. Serra. El 2019, em vaig traslladar a l'Hospital Universitari Germans Trias i Pujol (HUGTP) per coordinar la Unitat de Genòmica Clínica i vaig ser reconegut com a investigador principal emergent a l'IGTP. Des de llavors, s'ha establert una activitat de recerca translacional centrada en pacients de la CSUR. Com a resultat, s'han publicat diversos treballs: 1) vam utilitzar per primera vegada oligonucleòtids antisentit com a possible estratègia terapèutica per a pacients amb NF2 (PMID: 23188051, 36420221); 2) vam aprofundir en l'ús de tècniques genòmiques per realitzar diagnòstics diferencials de Neurofibromatosis (PMID: 25739810) i millorar l'assessorament genètic (PMID: 35121649); 3) vam estudiar la patogènesi molecular de les plaques cutànies de NF2, útil per establir un diagnòstic precoç (PMID: 29322178, 35490384); i 4) hem millorat l'escala de risc genètic de NF2 publicada pel centre de referència del Regne Unit (Halliday 2017) per predir el pronòstic dels pacients amb variants de splicing i mosaïcisme (PMID: 34348961).
En l'àrea d'innovació, vaig desenvolupar, validar i implementar a l'activitat diagnòstica de rutina un panell NGS personalitzat de 135 gens de càncer hereditari, l'I2HCP (PMID: 28051113), i també per diagnosticar genèticament les Rasopaties i síndromes relacionats (PMID: 31573083). Aquest desenvolupament va transformar tecnològicament les dues unitats de diagnòstic genètic on s'ha implementat (HUGTP i ICO) i ens va permetre unir forces per homogeneïtzar les tècniques utilitzades en altres centres, com l'Hospital Universitari Vall d'Hebron.
Actualment, més de 8000 pacients visitats a l'ICO o al nostre centre han estat diagnosticats genèticament amb aquest desenvolupament tecnològic. A més, he col·laborat en la recerca de nous gens associats a la Schwannomatosi (PMID: 34747535) o nous mètodes d'anàlisi genòmica per millorar les proves genètiques (PMID: 35569879, 32561899, 33983414, 36818284).
Gràcies a la meva experiència en proves genètiques de la Neurofibromatosis i trastorns relacionats, actualment codirigeixo amb el Dr. Plotkin (MGH, EUA) el grup d'experts del ClinGen-NIH per a la curació de variants d'aquest grup de malalties (NF-SWN VCEP) i també coordino el consorci internacional EURONET-NF per millorar el diagnòstic molecular d'aquest grup de trastorns.
Finalment, amb la intenció de generar un model cel·lular de NF2 no perible per provar les diferents estratègies terapèutiques desenvolupades al laboratori, hem generat cèl·lules iPSC amb la variant germinal i somàtica (NF2(-/-)) (Catasús et al., en revisió) i hem col·laborat en la generació de iPSC de NF1 (PMID: 35172160, 30713041).
En els darrers 5 anys, 4 dels quals com a investigador principal associat a l'Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP), he aconseguit finançament per desenvolupar diferents línies de recerca i liderar els consorcis esmentats mitjançant projectes competitius a nivell regional, nacional i internacional i de diverses associacions de pacients, per un valor total superior als 2.300.000€. Participem en els programes de l'ISCIII "Data Science Program IMPaCT-Data, convocatòria 2021" i "iPHARMGx", convocatòria 2022. A més, he obtingut finançament per contractar una doctoranda, Núria Catasús, que va defensar la seva tesi el maig de 2022, i m'encarrego de la formació en genètica de residents clínics a l'HUGTP.
També hem difós aquesta feina i altres assoliments científics a través de notícies al web de l'institut de recerca, conferències de divulgació científica al nostre centre, així com col·laboracions regulars amb associacions de pacients, principalment l'Associació de Pacients amb Neurofibromatosis (AANF) i la Children's Tumour Foundation (CTF) en les conferències que organitzen.
- Elisabeth Castellanos Pérez
Elisabeth Castellanos Pérez
Elisabeth Castellanos co-dirigeix, juntament amb Scott Plotkin (Massachusetts General Hospital, EUA), el Neurofibromatoses and Schwannomatosis Variant Curation Expert Panel (NF-SWN VCEP) a ClinGen-NIH, amb l'objectiu d'establir guies clíniques per classificar variants genètiques d'aquestes malalties. El panell ha estat finançat per National Institutes of Health (NIH) mitjançant una subvenció U24. Castellanos també coordina el consorci internacional EURONET-NF, que té com a objectiu millorar les proves diagnòstiques moleculars per aquest grup de trastorns. Col·labora estretament amb la Children's Tumor Foundation (CTF) i va ser convidada com a co-presidenta de sessió a la Conferència NF de la CTF 2023 a Scottsdale, EUA, per actualitzar els avenços del NF-SWN VCEP i també a la 2024 NF Global Conference per presidir una sessió sobre teràpia gènica. El 2023, Castellanos va renovar la seva beca P-FIS i va obtenir una beca Sara Borrell per al període 2024-2026. Finalment, col·labora amb Plotkin per desenvolupar noves teràpies genètiques per a la neurofibromatosi tipus 2.
Contacte: Ecastellanosp.germanstrias(ELIMINAR)@gencat.cat
ORCID: 0000-0002-8133-5325
Equip
Investigadores associades
Sandra Bonache, PhD(ELIMINAR)
Núria Catasús, PhD(ELIMINAR)
Assistent de recerca
Aida Marisch(ELIMINAR)
Conselleres genètiques
Andrea Ros(ELIMINAR)
Belen Garcia(ELIMINAR)
Becària de recerca clínica
Mª del Mar Rovira(ELIMINAR)
Estudiants de doctorat
Gemma Casals, MD(ELIMINAR)
Daniel Muñoz(ELIMINAR)
Personal tècnic
Inma Rosas(ELIMINAR)
Ester Romera(ELIMINAR)
Aida Silvero(ELIMINAR)
Bioinformàtic
Miguel Cidrás(ELIMINAR)
Línies de recerca
- Augment de la rendibilitat econòmica de les proves genètiques i del nostre coneixement sobre la base genètica d'algunes malalties (principalment malalties hereditàries amb predisposició al desenvolupament de tumors, així com malalties renals).
- Desenvolupament de medicina personalitzada per a pacients amb neurofibromatosis i schwannomatosis, que inclou el descobriment de nous biomarcadors pronòstics, la comprensió del paper de les alteracions genòmiques dels pacients en el desenvolupament de lesions associades a la malaltia i la implementació de diferents estratègies de teràpia gènica com a tractament potencial per a aquest grup de malalties.
- Millora de la gestió dels pacients amb facomatosis, tenint en compte no només el diagnòstic clínic, sinó també les dimensions emocionals, socials, religioses i físiques que podrien afectar els pacients amb aquestes malalties rares.
- Desenvolupament d'estratègies per avaluar la susceptibilitat genètica individual a malalties.
Projectes actius
EURONET- NF: European Network for improved molecular diagnostics of the NeuroFibromatoses - schwannomatoses and related disorders
PI: Elisabeth Castellanos
Funding agency: European Joint Program for Rare Diseases (EJP -RD) a través de "Proyectos de colaboración internacional" del Instituto de Salud Carlos III (AC22/00033)
Agency code: EJPRD22-084
Duration: 01/06/2023 - 31/05/2026
Developing NF2 iPSC-cell models for the use of antisense oligonucleotides as a personalized therapy for Neurofibromatosis Type 2 patients
PI: Elisabeth Castellanos
Funding agency: Children's Tumor Foundation
Agency code: CTF-2022-05-005
Duration: 01/02/2023 - 31/01/2024
Suppression of NF1 Nonsense Mutations by RNA-guided RNA Pseudouridylation
PI: Elisabeth Castellanos, Yi Tao, Conxi Lazaro, Pedro Marais
Funding agency: Gilbert Family Foundation
Duration: 01/01/2022 - 31/12/2024
Plataforma de medicina de precisió, una eina necessària per la transformació del procés assistencial
PI: Ignacio Blanco
Funding agency: HUGTP
Duration: 01/01/2023 - 31/12/2026
Desarrollo de una estrategia de medicina personalizada para la NF2-SWN: mejora del diagnóstico genético, y evaluación de terapias génicas a nivel de RNA en un modelo de iPSCs de schwannomas
PI: Elisabeth Castellanos
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI23/00412
Duration: 01/01/2024 - 31/12/2026
Mejora del diagnóstico genético del cáncer hereditario y enfermedades hereditarias con predisposición a desarrollar tumores
PI: Elisabeth Castellanos
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: CD23/00038
Duration: 01/01/2024 - 31/12/2026
Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Catalonia: virological vigilance and control of outbreaks
PI: Marc Noguera Julián, Elisa Martró Català
Agency code: 1162/U/2021
Duration: 01/06/2021 - 31/05/2024
A patient centered research: awareness of patientsneeds, clinical phenotyping and molecular pathogenesis in Neurofibromatosis type 2
PI: Elisabeth Castellanos
Funding agency: Fundació La Marató de TV3
Agency code: P126/C/2020
Duration: 01/04/2021 - 31/03/2024
The human genetic and immunological determinants of the clinical manifestations of SARS-CoV-2 infection: Towards personalised medicine
PI: UNDINE Consortium; Collaborator: Ignacio Blanco
Funding agency: Horizon Europe
Duration: 01/09/2022 - 31/12/2026
Consolidation of WGS and RT-PCR activities for SARS-CoV-2 in Spain towards sustainable use and integration of enhanced infrastructure and processes in the RELECOV network
PI: Inmaculada Casas; Collaborator: Ignacio Blanco
Duration: 01/01/2023 - 31/12/2026
Proyecto iPHARMGx: Estudio colaborativo nacional para evaluar la efectividad y eficiencia de la implementación de biomarcadores farmacogenéticos mediante una estrategia de genotipado anticipado en el SNS
PI: Alberto M Borobia Perez
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: iPHARMGx
Duration: 01/01/2023 - 31/12/2025
Grups de Recerca Reconeguts per la Generalitat de Catalunya, GRC (Grup de Recerca Consolidat)
PI: Ignacio Blanco
Funding agency: Generalitat de Catalunya
Agency code: 2022 SGR 967
Duration: 01/01/2023 - 31/12/2025
Past projects
Desarrollo de una estrategia de medicina personalizada para la NF2: mejora del diagnóstico genético, la evaluación de la calidad de vida y generación de un modelo de schwannomas a partir de iPSCs
PI: Elisabeth Castellanos, Ignacio Blanco
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI20/00215
Start date: 01/01/2021
End date: 31/12/2023
NF Variant Curation Expert Panel (VCEP)
PI: Elisabeth Castellanos
Funding agency: National Institutes of Health (NIH) ClinGen Variant Curation Expert Panel (VCEP)
Start date: 27/12/2021
End date: 30/12/2023
Programa de Ciencia de Datos (IMPaCT-Data), Infraestructura de Medicina de Precisión asociada a la Ciencia y Tecnología (IMPaCT)
PI: Alfonso Valencia Herrera
Funding agency: Alliance for Education Solutions (AES)
Agency code: PI20/00215
Start date: 01/01/2021
End date: 31/12/2023
Publicacions científiques
Publicacions destacades
Catasús N, Rosas I, Bonache S, Negro A, Torres-Martin M, Plana-Pla A, Salvador H, Serra E, Blanco I, Castellanos E. Antisense oligonucleotides targeting exon 11 are able to partially rescue the NF2-related schwannomatosis phenotype in vitro. Mol Ther Nucleic Acids. 2022 Dec 13;30:493-505. DOI: 10.1016/j.omtn.2022.10.026.
Garcia B, Catasus N, Ros A, Rosas I, Negro A, Guerrero-Murillo M, Valero AM, Duat-Rodriguez A, Becerra JL, Bonache S, Lázaro Garcia C, Comas C, Bielsa I, Serra E, Hernández-Chico C, Martin Y, Castellanos E, Blanco I. Neurofibromatosis type 1 families with first-degree relatives harbouring distinct NF1 pathogenic variants. Genetic counselling and familial diagnosis: what should be offered?. J Med Genet. 2022 Oct;59(10):1017-1023. DOI: 10.1136/jmedgenet-2021-108301.
Catasús N, Garcia B, Galván-Femenía I, Plana A, Negro A, Rosas I, Ros A, Amilibia E, Becerra JL, Hostalot C, Rocaribas F, Bielsa I, Lazaro Garcia C, de Cid R, Serra E, Blanco I, Castellanos E. Revisiting the UK Genetic Severity Score for NF2: a proposal for the addition of a functional genetic component. J Med Genet. 2022 Jul;59(7):678-686. DOI: 10.1136/jmedgenet-2020-107548.
Castellanos E, Rosas I, Negro A, Gel B, Alibés A, Baena N, Pineda M, Pi G, Pintos G, Salvador H, Lázaro C, Blanco I, Vilageliu L, Brems H, Grinberg D, Legius E, Serra E. Mutational spectrum by phenotype: panel-based NGS testing of patients with clinical suspicion of RASopathy and children with multiple café-au-lait macules. Clin Genet. 2020 Feb;97(2):264-275. DOI: 10.1111/cge.13649.
Castellanos E, Plana A, Carrato C, Carrió M, Rosas I, Amilibia E, Roca-Ribas F, Hostalot C, Castillo A, Ros A, Quer A, Becerra JL, Salvador H, Lázaro C, Blanco I, Serra E, Bielsa I. Early Genetic Diagnosis of Neurofibromatosis Type 2 From Skin Plaque Plexiform Schwannomas in Childhood. JAMA Dermatol. 2018 Mar 1;154(3):341-346. DOI: 10.1001/jamadermatol.2017.5464.
Informació addicional
Xarxes col·laboratives
- CSUR de Facomatosis ICO-HGTP-IGTP. El Dr. Blanco és el coordinador d’un Centro de Referencia del Sistema Nacional de Salud.
- European Network of Reference Centers (ERN) GENTURIS (síndromes amb predisposició a tumors minoritaris).
- NF-EURONET: Xarxa europea per millorar les proves genètiques de neurofibromatosi, schwannomatosi i síndromes relacionades.
- Neurofibromatosis and Schwannomatosis Variant Curation Expert Panel (NF_SWN VCEP): Xarxa internacional reconeguda pel programa ClinGen del National Health Institute (NIH) per establir criteris de classificació ACMG/AMP específics de gens per a aquestes malalties.
- Grup de Recerca en Neurofibromatosis (GRNF) 2021 SGR 00967: Grup de Recerca Multidisciplinari en Neurofibromatosi reconegut per la Generalitat de Catalunya.
- XIGENICS: Xarxa integral de genètica de l'Institut Català de la Salut per implantar la medicina genòmica als hospitals de l'ICS.
- Can Ruti COVID sequencing HUB: Xarxa HGTP-IGTP-IrsiCaixa per caracteritzar les variants SARS-2-Covid detectades a la població.
- Children's Tumor Foundation Europe (CTF-Europe): La missió de la Children's Tumor Foundation Europe és impulsar la investigació, ampliar el coneixement i avançar en l'atenció a la comunitat NF.
Socis nacionals i internacionals
- Scott Plotkin, MD, PhD al Massachusetts General Hospital per participar en enfocaments de teràpia gènica per a NF2.
- Dr. Piotrowski a la Medical University of Gdanskv: caracterització de Schwannomes i descoberta de nous gens que indueixin aquest tipus de tumors.
- Dr. Lázaro al Programa de Càncer Hereditari de l'Institut Català d'Oncologia (ICO) per millorar les eines de diagnòstic genètic i la recerca en NF, així com projectes de recerca conjunts.
- Dr. Jordi Llorens, a la Facultat de Medicina i Ciències de la Salut (UB), juntament amb el Servei d'Otorinolaringologia de l'HUGTiP per estudiar la patogènesi dels Schwannomes vestibulars i la pèrdua auditiva.
- Grup de Neurofibromatosi de Barcelona (BCN_NF Group). El grup està compost per diferents grups que col·laboren en el camp de les Neurofibromatosis: el grup de la Dra. Conxi Lázaro, que va iniciar el primer grup NF a mitjans dels anys 90; el grup del Dr. Serra (Grup de Càncer Hereditari a l'IGTP) amb una gran experiència en l'estudi de la contribució de les variants somàtiques en el desenvolupament de tumors NF i també en el desenvolupament de models basats en iPSC per estudiar les NF; el grup de la Dra. Cleofé Romagosa (Departament de Patologia, Hospital Vall d'Hebron), patòloga especialista en sarcomes i experta en tumors del SNP associats a les NF, i el nostre grup.
Comitès i consells assessors
El Dr. Blanco és membre del consell assessor de:
- Associación Espanyola de Afectats por la Neurofibromatosi (AENF)
- Associació Catalana de Neurofibromatosi (AcNefi)
- Consell Assessor de Malalties Minoritàries del Departament de Salut de la Generalitat de Catalunya
- Consell Assessor de la Comissió Nacional de Reproducció Humana Assistida (CNRHA)
- Comitè Assessor de la Federació Espanyola de Malalties Rares (FEDER)
- Assessor del Ministeri de Sanitat d'Espanya en l'àrea de Genètica
Tesis doctorals
Title: Refining prognosis capacity and implementing principles of personalized therapies for Neurofibromatosis type 2
Author: Núria Catasús Segura
University: Universitat de Barcelona
Date of defense: 31/05/2022
Qualification: Cum Laude
Notícies
L’IGTP ofereix oportunitats de doctorat dins de la convocatòria INPhINIT Incoming 2025 de la Fundació "la Caixa"
La Fundació "la Caixa" convoca 30 beques per a investigadors i investigadores de totes les nacionalitats que vulguin cursar estudis oficials de doctorat en disciplines STEM en centres de recerca i unitats d'excel·lència d'Espanya i Portugal. L'IGTP està obert a acollir estudiants dins d'aquest programa. Les persones seleccionades podran incorporar-se en un dels grups de recerca de l'IGTP i desenvolupar la seva recerca en l'àrea d'estudi del seu interès.
L'IGTP i EATRIS refermen els seus vincles amb una jornada d'impuls a la recerca translacional amb la participació dels pacients
L’IGTP ha dedicat un acte a compartir els recursos, perspectives i avenços com a centre vinculat a EATRIS, amb un focus especial en la participació dels pacients en la investigació biomèdica.
Contacte
Elisabeth Castellanos