Hepatitis virales

Las hepatitis virales son un desafío mundial para la salud pública, comparable a otras enfermedades transmisibles importantes, como el VIH, la tuberculosis y la malaria. En 2016, la OMS lanzó la primera Estrategia del Sector Sanitario Mundial sobre la Hepatitis Viral con el objetivo de eliminarla como una amenaza para la salud pública antes del 2030. Para lograr este ambicioso objetivo, se requiere una rápida y masiva expansión del diagnóstico y el tratamiento.

Hepatitis C

La infección crónica por el virus de la hepatitis C (VHC) se caracteriza por una progresión lenta y silenciosa, y es la principal causa de morbilidad y mortalidad hepática a nivel mundial debido a complicaciones relacionadas con el VHC, que incluyen cirrosis, carcinoma hepatocelular e insuficiencia hepática. Con la llegada de nuevos fármacos antivirales altamente efectivos, la infección por el VHC se puede curar en la mayoría de los pacientes. Sin embargo, muchas personas infectadas desconocen su infección y, por tanto, no son candidatas para el tratamiento. Esto es especialmente relevante en poblaciones vulnerables, como personas que se inyectan drogas o migrantes de países endémicos.

La principal actividad de investigación de este grupo se centra en el estudio molecular del VHC e incluye aspectos de investigación básica orientada, clínica y de salud pública, que se han desarrollado mediante proyectos competitivos de investigación y acuerdos de colaboración con la industria. El grupo trabaja para la eliminación de la infección por el VHC en colaboración con la Agencia de Salud Pública de Cataluña (dentro del Plan para la Prevención y Control de la Hepatitis C en Cataluña), CEEISCAT y otros grupos, a través de dos estrategias principales:

• Mejora del diagnóstico de la infección activa por VHC y conexión con la atención sanitaria.
  • Diseño e implementación de nuevos ensayos diagnósticos y estrategias de cribado en entornos comunitarios y sanitarios.
  • Promoción de la microeliminación del VHC en poblaciones vulnerables mediante nuevos modelos de atención que incluyen educación, prevención, cribado, conexión con la atención y tratamiento, y combate contra la reinfección.
• Caracterización de la epidemiología molecular del VHC: evaluación de marcadores epidemiológicos (prevalencia, incidencia, infección aguda) y dinámicas de transmisión en poblaciones clave mediante la secuenciación de nueva generación y el análisis filogenético para entender cómo se propaga el virus y contribuir a su control.

Hepatitis B

Con respecto al virus de la hepatitis B (VHB), el grupo ha trabajado en dos actividades principales en poblaciones vulnerables:

• Diseño e implementación de nuevas estrategias de educación, cribado y conexión con la atención y el tratamiento.
• Evaluación de las necesidades de vacunación contra el VHB y estrategias de vacunación dirigidas.

El grupo también trabaja para expandir el cribado de las poblaciones vulnerables no solo para las hepatitis virales, sino también para otras enfermedades infecciosas como las infecciones de transmisión sexual (ITS) y la tuberculosis, de una manera integrada y centrada en las personas.

Diagnóstico molecular y epidemiología genómica de otras enfermedades infecciosas

En los últimos cinco años, este grupo de investigación ha aplicado su conocimiento en la secuenciación de nueva generación y el análisis filogenético, adquirido previamente en el campo del VHC, a otros patógenos de interés clínico y de salud pública. Mediante la secuenciación del genoma de muestras patógenas de pacientes, podemos estudiar el origen de los brotes, cómo se propagan y evolucionan, y qué estrategias pueden contenerlos. De esta manera, la genómica puede guiar las decisiones de los equipos de control de infecciones y las autoridades sanitarias sobre cómo dirigir sus esfuerzos para controlar la transmisión. Además, la secuenciación del genoma completo se ha convertido en el método de referencia para el tipado y estudio de la resistencia antimicrobiana para un número creciente de patógenos. La genómica de patógenos se utiliza cada vez más para una nueva generación de diagnósticos y terapias.

Coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 (SARS-CoV-2)

Tras la primera ola pandémica de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), la aparición de variantes del SARS-CoV-2 ha provocado oleadas de infecciones en todo el mundo. Con la pandemia de COVID-19, la vigilancia genómica se ha implementado a gran escala a nivel mundial por primera vez, con una generación de datos genómicos sin precedentes, superior a cualquier otro patógeno.

• La vigilancia genómica de las variantes circulantes, para la detección precoz de mutaciones, el seguimiento de la evolución del virus y la evaluación de cómo las variantes podrían dificultar la detección mediante pruebas diagnósticas, así como influir en la efectividad de las vacunas y los antivirales, para finalmente informar las intervenciones de salud pública.
• Estudios de epidemiología genómica de brotes en hospitales, residencias de ancianos y otros entornos cerrados, con el fin de caracterizar la propagación del virus y traducir la información genómica en informes clínicos significativos para los equipos de control de infecciones, para mejorar el control de los brotes.

El grupo también trabaja para expandir esta línea de investigación a otros virus respiratorios, como el virus de la gripe y el virus respiratorio sincitial (VRS).

Tuberculosis (TB)

A nivel mundial, la TB es la segunda causa de muerte por infección después del COVID-19 (por delante del VIH/SIDA). La TB multirresistente a los fármacos (TB-MDR) sigue siendo una preocupación para la salud pública y una amenaza para la seguridad sanitaria. Poner fin a la epidemia de TB para 2030 es uno de los objetivos sanitarios de los Objetivos de Desarrollo Sostenible de las Naciones Unidas. A pesar de los avances significativos en el control de la transmisión del complejo Mycobacterium tuberculosis (MTBC), las estrategias tradicionales de rastreo de contactos tienen limitaciones que se pueden superar utilizando datos de secuenciación del genoma completo (WGS) como marcador epidemiológico de alta resolución.

El grupo lideró un estudio pionero, prospectivo y multicéntrico sobre la epidemiología genómica de las cepas de MTBC circulantes en Cataluña, en colaboración con Iñaki Comas (IBV-CSIC), Pere-Joan Cardona (CIBERES), CEEISCAT y otros grupos de investigación dentro de CIBERESP, y una red de laboratorios públicos y privados, que se implementó posteriormente dentro del Programa de Prevención y Control de la Tuberculosis (Departamento de Salud, Generalitat de Cataluña), con los siguientes objetivos:

• Caracterizar mediante WGS cómo se transmite la TB en Cataluña y sus determinantes, con el fin de mejorar el control y la prevención de esta infección y, en última instancia, implementar e integrar la genómica de MTBC en las actividades de vigilancia epidemiológica formal en Cataluña.
• Evaluar el uso de WGS como nueva metodología de referencia para la detección de marcadores de resistencia en el laboratorio de microbiología clínica.

En 2024 se ha concedido un nuevo proyecto para el diseño y pilotaje de una nueva estrategia descentralizada de cribado de tuberculosis, integrada en los programas de cribado de hepatitis virales y VIH/ITS en poblaciones vulnerables.

Bacterias resistentes a los antimicrobianos

Epidemiología genómica de brotes y cepas circulantes de bacterias multirresistentes, incluyendo Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasas o beta-lactamasas de espectro extendido (ESBL) y/o Enterococcus faecium resistente a la vancomicina, o Staphylococcus aureus resistente a la meticilina. Validación de ensayos moleculares para el diagnóstico de infecciones bacterianas y genes de resistencia en colaboración con la industria. El grupo ha trabajado especialmente en el diagnóstico molecular de la sepsis, un síndrome dependiente del tiempo que representa la principal causa de muerte por infección a nivel mundial; por tanto, reducir el tiempo hasta el diagnóstico microbiológico salva vidas. Más recientemente, se está validando un ensayo de secuenciación en tiempo real del 16S rRNA a partir de muestras clínicas directas para el diagnóstico microbiológico de infecciones que requieren un diagnóstico urgente y los métodos diagnósticos convencionales presentan limitaciones.

Infecciones de transmisión sexual (ITS)

La prevalencia de las ITS está aumentando actualmente en todo el mundo. Este grupo de investigación ha optimizado varias técnicas de diagnóstico adaptadas al muestreo mínimamente invasivo (especialmente orina, saliva y sangre capilar) para el cribado de ITS en poblaciones vulnerables que asisten a centros de pruebas alternativos, contribuyendo a su caracterización epidemiológica con aplicaciones de salud pública. También ha realizado estudios de diagnóstico molecular y epidemiología del virus del papiloma humano (VPH), Treponema pallidum, y el virus del mono (Monkeypox).

Pilot hepatitis C simplified screening and linkage to treatment strategy in community pharmacies (HepTestFarma)

PI: Elisa Martró
Funding agency: Becas Gilead a Proyectos de Microeliminación en Hepatitis C (5ª Convocatoria, 2022)
Agency code: GIL181
Duration: 01/01/2023 - 31/12/2024

Cost-effectiveness of a community intervention versus a healthcare-based strategy for promoting the prevention, diagnosis and treatment of hepatitis B and C in immigrants in Catalonia (HepBClink)

PI: Elisa Martró
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI19/0568
Duration: 01/01/2020 - 31/12/2024

New decentralized screening strategy of tuberculosis, integrated into viral hepatitis and HIV/STI screening programs in vulnerable populations (IntegraTB)

PI: Elisa Martró
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI23/00528
Duration: 01/01/2024 – 31/12/2026

Brand-specific COVID-19 vaccine effectiveness against severe COVID-19 disease in Europe (COVIDRIVE)

PI: International consortium coordinated by FISABIO; PI at IGTP: Irma Casas
Funding agency: P-95 CVBA Development Aid
Agency code: COVIDRIVE
Duration: 24/05/2021 - 31/05/2024
More information

Defining the best strategy for global HCV screening, linkage-to-care, education and prevention in PWID population

PI: Sabela Lens
Funding agency: Gilead Sciences, Inc (Foster City CA, EEUU) (HCV CHIME program: Conquering Hepatitis vIa Micro-Elimination)
Duration: 01/10/2018 – 30/09/2024

Epidemiological modelling of SARS-CoV2 in a post-pandemic surveillance context: an open platform for mid-term scenarios and short-term predictions

PI: Clara Prats Soler
Funding agency: Fundación BBVA
Duration: 01/07/2022 - 30/06/2024

Grup de Microbiologia Clínica i Patologia Infecciosa Experimental. Ajuts de suport als grups de recerca consolidats de Catalunya

PI: Pere-Joan Cardona
Funding agency: Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)
Agency code: 2021 SGR 00931
Duration: 2022 - 2024

Consolidation of WGS and RT-PCR activities for SARS-CoV-2 in Spain towards sustainable use and integration of enhanced infrastructure and processes in the RELECOV network (RELECOV 2.0)

PI: Inmaculada Casas (ISCIII); PI at IGTP: Pere-Joan Cardona
Degree of contribution: Steering Committee
Funding agency: Horizon Europe: EU4H Project Grants
Agency code: EU4H-2022-DGA-MS-IBA-01-02
Duration: 01/07/2023 – 30/06/2025
More information

Screening of bloodborne viruses in the emergency department of Hospital Germans Trias i Pujol

PI: Rosa Mª Morillas, Elisa Martró, Anna Carreres, Eugènia Negredo
Funding agency: Gilead Sciences, S.L.U.
Agency code: FOCUS Program
Duration: 27/06/2022 – 26/09/2024

Centre de suport del Programa de Vigilància de la Tuberculosi a Catalunya

PI: Pere-Joan Cardona
Funding agency: Departament de Salut, Generalitat de Catalunya
Agency code: GC106/2022
Duration: 2022 -2024

Population-based genomic epidemiology study for tailored strategies for surveillance and control of tuberculosis (TB-SEQ)

PI: Elisa Martró. Co-PI: Iñaki Comas
Funding agency: CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Instituto de Salud Carlos III (ISCII)
Agency code: ESP22PI06
Duration: 01/01/2022 - 31/12/2023
Video

Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Catalonia: virologic surveillance and outbreak control

PI: Marc Noguera (IrsiCaixa). Co-PI: Elisa Martró (IGTP, CIBERESP)
Funding agency: Fundació Marató de TV3
Agency code: 342/C/2021
Duration: 23/09/2021 - 22/09/2023

Enhancing Whole Genome Sequencing (WGS) and/or Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) national infrastructures and capacities to respond to the COVID-19 pandemic in the EU and EEA

PI: Cristobal Belda Iniesta (ISCIII) ; PI at IGTP: Ignacio Blanco, Pere-Joan Cardona
Funding agency: European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC)
Agency code: ECDC.HERA.2021.024
Duration: 03/09/2021 - 30/09/2022

Development of Robust and Innovative Vaccine Effectiveness (IMI-DRIVE_3)

PI: International consortium coordinated by FISABIO. PI at IGTP: Guillermo Mena, Irma Casas
Funding agency: Innovative Medicines Initiative
Duration: 15/09/2021 - 30/06/2022

Title: Micro-elimination of hepatitis B and C in vulnerable populations through new strategies for the promotion of education, screening and treatment
Author: Anna Not
Director: Elisa Martró
University: Universitat Autònoma de Barcelona (UAB)
Date of defense: expected in 2024

Title: Feasibility and acceptability of new models of hepatitis B care among African populations: implications for achieving the WHO viral hepatitis elimination targets.
Author: Camila Picchio (ISGlobal)
Directors: Jeffrey V. Lazarus, Elisa Martró
University: Universitat de Barcelona (UB)
Date of defense: 11/2023

Title: Improving the diagnosis and molecular characterization of viremic infection by the Hepatitis C virus in people who inject drugs
Author: Adrián Antuori (HUGTiP)
Directors: Elisa Martró, Verónica Saludes
University: Universitat Autònoma de Barcelona (UAB)
Date of defense: 03/2022