Presentació

El Grup de Recerca en Diagnòstic i Epidemiologia Genòmica de Patògens (DxEpiPath), anteriorment conegut com a Grup en Virologia Clínica i Noves Eines Diagnòstiques, es va crear en 2010 i fomenta la recerca traslacional multidisciplinària per a millorar la prevenció, el diagnòstic i el tractament de les infeccions causades per virus i altres microbis patògens que tinguin un impacte en aplicacions clíniques i la salut pública. A través de noves eines diagnòstiques i models d'atenció sanitària, el grup està contribuint a eliminar les hepatitis víriques en poblacions vulnerables. L'equip també està aplicant diferents estratègies de seqüenciació genòmica per a caracteritzar l'epidemiologia i contribuir al control dels microbis patògens altament transmissibles, que sovint són els responsables dels brots epidèmics. El grup s'especialitza en epidemiologia genòmica i vigilància del SARS-CoV-2, la tuberculosi, el virus de la verola símica i els bacteris farmacoresistents. Quant a la tuberculosi, Elisa Martró va dirigir un estudi poblacional d'epidemiologia genòmica realitzat en múltiples centres de Catalunya sobre soques del complex Mycobacterium tuberculosis (TB-SEQ), que va donar lloc a l'aplicació d'aquesta nova estratègia en les activitats oficials de prevenció i control de la tuberculosi, en les quals participa tot el grup.

El grup està ubicat al Servei de Microbiologia del Laboratori Clínic de l'àrea Metropolitana Nord de l'Hospital Universitari Germans Trias i Pujol i forma part del Grup de Microbiologia Clínica i Patologia Infecciosa Experimental, un Grup de Recerca Consolidat i finançat per la Generalitat de Catalunya (2021 SGR 00931). Tres membres del grup pertanyen al Centre de Recerca Biomèdica en Xarxa Epidemiologia i Salut Pública (grup 27 CIBERESP, juntament amb el CEEISCAT).

Paraules clau: diagnòstic molecular, vigilància genòmica, epidemiologia genòmica, brots epidèmics, hepatitis vírica, SARS-CoV-2, tuberculosi, resistència als antimicrobians (RAM).

Pathogen Diagnostics and Genomic Epidemiology

Líder/s de grup

  • Elisa Martró, PhD
    Elisa Martró, PhD

    Elisa Martró, PhD

    Elisa Martró, doctora en Biologia i investigadora sènior, va realitzar el Màster en Microbiologia Clínica al Servei de Microbiologia de l'Hospital Universitari Germans Trias i Pujol (HUGTiP), dins de l'Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP), centrat en la tuberculosi. A mesura que es va interessar per la investigació sobre infeccions víriques, va dur a terme la part experimental del seu doctorat de 2001 a 2003 com a investigadora convidada als Centres per al Control i la Prevenció de Malalties (CDC) a Atlanta, EUA, centrant-se en els herpesvirus humans (HVH-8 i EBV). Al seu retorn, va passar un any al Centre d'Estudis Epidemiològics sobre el VIH/SIT de Catalunya (CEEISCAT), treballant en el sarcoma de Kaposi i el VIH. Va defensar la seva tesi doctoral el 2005, per la qual va rebre dos premis.

    De tornada al Servei de Microbiologia de l'HUGTiP, la Dra. Martró va iniciar una línia de recerca sobre el virus de l'hepatitis C (VHC) el 2006 com a postdoc, i des del 2010 com a investigadora principal del grup de recerca en Virologia Clínica i Noves Eines Diagnòstiques (programa Miguel Servet per a Investigadors del Sistema Nacional de Salut). La recerca del seu grup sobre el VHC s'ha centrat en l'estudi de la variabilitat genètica del virus i les seves aplicacions tant en epidemiologia clínica com molecular, i en la millora del diagnòstic en diverses poblacions vulnerables de la comunitat a través de nous assajos moleculars i estratègies de cribratge. El seu treball sobre la caracterització de l'epidèmia local del VHC la va portar a participar en la Comissió per a l'elaboració i seguiment del "Pla de prevenció i control de l'hepatitis C a Catalunya" de l'Agència de Salut Pública de Catalunya (ASPCAT).

    Des del 2020, l'enfocament de la seva recerca es va expandir al diagnòstic molecular i epidemiologia genòmica de diversos virus i bacteris que impliquen aspectes clínics i de salut pública, per la qual cosa va canviar el nom del seu grup de recerca dins de l'IGTP com a Diagnòstic i Epidemiologia Genòmica de Patògens (DxEpiPath), i es va convertir en investigadora principal sènior (R4) el 2024. Martró va ser co-lideradora de l'estudi pilot TB-SEQ d'epidemiologia genòmica de la tuberculosi basada en la població a Catalunya, que va contribuir a la implementació d'aquesta estratègia per l'ASPCAT el 2022. Moltes de les noves tècniques desenvolupades dins dels seus projectes de recerca s'han implementat en l'activitat rutinària del Servei de Microbiologia, per a la qual codirigeix l'Àrea de Seqüenciació juntament amb Verónica Saludes. E. Martró pertany al Grup de Microbiologia Clínica i Patologia Infecciosa Experimental de l'IGTP liderat pel Dr. P.J. Cardona (2021 SGR 00931), i està en procés de convertir-se en PI del Grup 27 del CIBER en Epidemiologia i Salut Pública (CIBERESP) de l'Institut de Salut Carlos III.

    Contacte: emartro(ELIMINAR)@igtp.cat
    ORCID: 0000-0002-2867-6649

Equip

Investigadora co-directora de l'Àrea de seqüenciació
Verónica Saludes, PhD(ELIMINAR)

Investigadors bioinformàtics
Antoni E. Bordoy, PhD(ELIMINAR)
Poppy J. Hesketh-Best, PhD(ELIMINAR)

Investigadores
Alexia París, MSc(ELIMINAR)
Maria Piñana, PhD(ELIMINAR)

Estudiant de doctorat
David Panisello, MSc(ELIMINAR)

Tècnics de laboratori
Sara González(ELIMINAR)
Aniol Català(ELIMINAR)
​​​

Línies de recerca

Hepatitis víriques

Les hepatitis víriques són un desafiament mundial per a la salut pública, comparable a altres malalties transmissibles importants, com el VIH, la tuberculosi i la malària. L'any 2016, l'OMS va llançar la primera Estratègia del Sector Sanitari Mundial sobre la Hepatitis Vírica amb l'objectiu d'eliminar-la com una amenaça per a la salut pública abans del 2030. Per assolir aquest ambiciós objectiu, es requereix una ràpida i massiva expansió del diagnòstic i el tractament.

Hepatitis C

La infecció crònica pel virus de l'hepatitis C (VHC) es caracteritza per una progressió lenta i silenciosa, i és la principal causa de morbiditat i mortalitat hepàtica a nivell mundial a causa de complicacions relacionades amb el VHC, que inclouen cirrosi, carcinoma hepatocel·lular i insuficiència hepàtica. Amb l'arribada de nous fàrmacs antivirals altament efectius, la infecció pel VHC es pot curar en la majoria de pacients. Tanmateix, moltes persones infectades desconeixen la seva infecció i, per tant, no són candidates per al tractament. Això és especialment rellevant en poblacions vulnerables, com persones que s'injecten drogues o migrants de països endèmics.

L'activitat principal de recerca d'aquest grup se centra en l'estudi molecular del VHC i inclou aspectes de recerca bàsica orientada, clínica i de salut pública, que s'han desenvolupat mitjançant projectes competitius de recerca i acords de col·laboració amb la indústria. El grup treballa per a l'eliminació de la infecció pel VHC en col·laboració amb l'Agència de Salut Pública de Catalunya (dins del Pla per a la Prevenció i Control de l'Hepatitis C a Catalunya), CEEISCAT i altres grups, a través de dues estratègies principals:

  • Millora del diagnòstic de la infecció activa per VHC i enllaç amb l'atenció sanitària.
    • Disseny i implementació de nous assajos diagnòstics i estratègies de cribratge en entorns comunitaris i sanitaris.
    • Promoció de la microeliminació del VHC en poblacions vulnerables mitjançant nous models d'atenció que inclouen educació, prevenció, cribratge, i enllaç amb l'atenció i el tractament, i combaten la reinfecció.
  • Caracterització de l'epidemiologia molecular del VHC: l'avaluació de marcadors epidemiològics (prevalença, incidència, infecció aguda) i dinàmiques de transmissió en poblacions clau mitjançant la seqüenciació de nova generació i l'anàlisi filogenètica per entendre com es propaga el virus i contribuir al seu control.

Hepatitis B

Pel que fa al virus de l'hepatitis B (VHB), el grup ha treballat en dues activitats principals en poblacions vulnerables:

  • Disseny i implementació de noves estratègies d'educació, cribratge, i enllaç amb l'atenció i el tractament.
  • Avaluació de les necessitats de vacunació contra el VHB i estratègies de vacunació dirigides.

El grup també treballa per expandir el cribratge de les poblacions vulnerables no només per a les hepatitis víriques, sinó també per a altres malalties infeccioses com les infeccions de transmissió sexual (ITS) i la tuberculosi, d'una manera integrada i centrada en les persones.

Diagnòstic molecular i epidemiologia genòmica d'altres malalties infeccioses

En els darrers cinc anys, aquest grup de recerca ha aplicat el seu coneixement en la seqüenciació de nova generació i l'anàlisi filogenètica, adquirit prèviament en el camp del VHC, a altres patògens d'interès clínic i de salut pública. Mitjançant la seqüenciació del genoma de mostres patògenes de pacients, podem estudiar l'origen dels brots, com es propaguen i evolucionen, i quines estratègies poden contenir-los. D'aquesta manera, la genòmica pot guiar les decisions dels equips de control d'infeccions i les autoritats sanitàries sobre com dirigir els seus esforços per controlar la transmissió. A més, la seqüenciació del genoma complet s'ha convertit en el mètode de referència per al tipatge i l'estudi de la resistència antimicrobiana per a un nombre creixent de patògens. La genòmica dels patògens s'utilitza cada vegada més per a una nova generació de diagnòstics i teràpies.

Coronavirus del síndrome respiratori agut greu 2 (SARS-CoV-2)

Després de la primera onada pandèmica de la malaltia per coronavirus 2019 (COVID-19), l'aparició de variants del SARS-CoV-2 ha provocat onades d'infeccions a tot el món. Amb la pandèmia de COVID-19, la vigilància genòmica s'ha implementat a gran escala a nivell mundial per primera vegada, amb una generació de dades genòmiques sense precedents, superior a qualsevol altre patogen.

  • La vigilància genòmica de les variants circulants, per a la detecció precoç de mutacions, el seguiment de l'evolució del virus i l'avaluació de com les variants podrien dificultar la detecció mitjançant proves diagnòstiques, així com influir en l'efectivitat de les vacunes i els antivirals, per finalment informar les intervencions de salut pública.
  • Estudis d'epidemiologia molecular de brots en hospitals, residències per a persones grans i altres entorns tancats, per tal de caracteritzar la propagació del virus i traduir la informació genòmica en informes clínics significatius per als equips de control d'infeccions, per millorar el control dels brots.

El grup també treballa per expandir aquesta línia de recerca a altres virus respiratoris, com el virus de la grip i el virus respiratori sincicial (VRS).

Tuberculosi (TB)

A nivell mundial, la TB probablement ha tornat a ser la principal causa de mort per un únic agent infecciós al món (substituint la COVID-19 i per sobre del VIH/SIDA). La TB multiresistent als fàrmacs (TB-MDR) continua sent una preocupació per a la salut pública i una amenaça per a la seguretat sanitària. Acabar amb l'epidèmia de TB per al 2030 és un dels objectius sanitaris dels Objectius de Desenvolupament Sostenible de les Nacions Unides. Malgrat els avenços significatius en el control de la transmissió del complex Mycobacterium tuberculosis (MTBC), les estratègies tradicionals de rastreig de contactes tenen limitacions que es poden superar utilitzant dades de seqüenciació del genoma complet (WGS) com a marcador epidemiològic d'alta resolució.

El grup va liderar un estudi pioner, prospectiu i multicèntric sobre l'epidemiologia genòmica de les soques de MTBC circulants a Catalunya (TB-SEQ), coliderat per Iñaki Comas (IBV-CSIC), en col·laboració directa amb Pere-Joan Cardona (CIBERES) i una xarxa de laboratoris públics i privats, que posteriorment es va implementar dins de les activitats formals de prevenció i control de la tuberculosi per part de l'Agència de Salut Pública de Catalunya (Departament de Salut, Generalitat de Catalunya) des del 2022, amb els següents objectius principals:

  • Caracterització mitjançant epidemiologia genòmica de com es transmet la TB a Catalunya i els seus determinants, per tal de millorar el control d'aquesta infecció. Els membres del grup pertanyen al multidisciplinari "Grup d'Experts en WGS Aplicat a la Salut Pública", que discuteix periòdicament les característiques genòmiques i epidemiològiques dels brots en curs.
  • Avaluar l'ús de WGS com a nova metodologia de referència per a la detecció de marcadors de resistència en el laboratori de microbiologia clínica.

El 2024, es va finançar un nou projecte (PI23/00528) per desenvolupar i pilotar una nova estratègia descentralitzada de cribratge de la tuberculosi, integrada en programes de cribratge d'hepatitis viral i VIH/ITS en poblacions vulnerables. Durant el projecte TB-SEQ, l'evidència ha demostrat la implicació de poblacions vulnerables (incloses persones que consumeixen drogues, persones sense llar i migrants de països amb una alta incidència de TB) en grups de transmissió recent. A partir d'aquestes troballes, aquest projecte pretén combatre els focus de transmissió, millorant el cribratge de la tuberculosi activa en la majoria de les poblacions afectades i integrant el cribratge de totes les infeccions que afecten aquestes poblacions vulnerables alhora.

Bacteris resistents als antimicrobians

  • Epidemiologia molecular de brots i soques circulants de bacteris multiresistents, incloent-hi Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemases o beta-lactamases d'espectre estès (ESBL) i/o Enterococcus faecium resistent a la vancomicina, o Staphylococcus aureus resistent a la meticil·lina, entre altres.
  • Validació d'assajos moleculars per al diagnòstic d'infeccions bacterianes i gens de resistència en col·laboració amb la indústria. El grup ha treballat especialment en el diagnòstic molecular de la sèpsia, una síndrome dependent del temps que representa la principal causa de mort per infecció a nivell mundial; per tant, reduir el temps fins al diagnòstic microbiològic salva vides.

Infeccions de transmissió sexual (ITS)

La prevalença de les ITS està augmentant actualment a tot el món. Aquest grup de recerca ha optimitzat diverses tècniques de diagnòstic adaptades al mostreig mínimament invasiu (especialment orina, saliva i sang capil·lar) per al cribratge d'ITS en poblacions vulnerables que assisteixen a centres de proves alternatius, contribuint a la seva caracterització epidemiològica amb aplicacions de salut pública. També ha realitzat estudis de diagnòstic molecular i epidemiologia del virus del papil·loma humà (VPH) i el virus del mico (Monkeypox).

Aplicacions de seqüenciació de rRNA 16S

S'ha validat un assaig de seqüenciació de rRNA 16S basat en nanoporus a partir de mostres clíniques directes per al diagnòstic microbiològic molecular d'infeccions complexes que necessiten un diagnòstic urgent i els mètodes de diagnòstic convencionals mostren limitacions.

El mateix assaig de seqüenciació s'utilitza per caracteritzar la microbiota bacteriana associada a malalties específiques. El camp de la investigació de la microbiota s'està expandint ràpidament, impulsat pel seu potencial per revolucionar la nostra comprensió de la salut i la malaltia. El grup col·labora en diversos projectes amb diferents serveis clínics de l'HUGTiP, inclòs el Servei de Microbiologia (projecte PI24/01595, PI: Pere-Joan Cardona, centrat en la microbiota bacteriana intestinal i la malaltia enterocòccica invasiva).

Projectes actius

Estimation of the incidence and characterization of the profile of hepatitis C virus acute infections among people who inject drugs accessing harm reduction centers: how far is Catalonia from elimination goals?

PI: Elisa Martró
Funding agency: Gilead Sciences, S.L. - 7ª Convocatoria de Becas Gilead a proyectos de Microeliminación en Hepatitis C y de Diagnóstico y Vinculación al SNS de pacientes con Hepatitis D, evaluated by AEEH
Duration: 01/01/2025 - 31/12/2025

Brand-specific COVID-19 vaccine effectiveness against severe COVID-19 disease in Europe (COVIDRIVE)

PI: International consortium coordinated by FISABIO; PI at IGTP: Irma Casas
Funding agency: P-95 CVBA Development Aid
Agency code: COVIDRIVE
Duration: 24/05/2021 - 31/01/2025
More information

New decentralized screening strategy of tuberculosis, integrated into viral hepatitis and HIV/STI screening programs in vulnerable populations (IntegraTB)

PI: Elisa Martró
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI23/00528
Duration: 01/01/2024 - 31/12/2026

Brand-specific COVID-19 vaccine effectiveness against severe COVID-19 disease in Europe - A contribution of id.DRIVE, a public-private partnership to estimate brand-specific COVID-19 vaccine effectiveness in Europe (id.Drive) 

PI: Coordinated by P95 and FISABIO. Site PIs at IGTP: I. Casas/E. Martró
Funding agency: Public-Private Partnership (P-95 CVBA Development Aid) 
Duration: 01/02/2025 - 31/08/2025
More information 

Consolidation of WGS and RT-PCR activities for SARS-CoV-2 in Spain towards sustainable use and integration of enhanced infrastructure and processes in the RELECOV network (RELECOV 2.0)

PI: Inmaculada Casas (ISCIII); PI at IGTP: Pere-Joan Cardona
Degree of contribution: Steering Committee
Funding agency: Horizon Europe: EU4H Project Grants
Agency code: EU4H-2022-DGA-MS-IBA-01-02
Duration: 01/07/2023 – 31/03/2026
More information

Centre de suport del Programa de Vigilància de la Tuberculosi a Catalunya

PI: Pere-Joan Cardona
Funding agency: Departament de Salut, Generalitat de Catalunya
Agency code: GC106/2022
Duration: 2022 – to date

Projectes anteriors

Population-based genomic epidemiology study for tailored strategies for surveillance and control of tuberculosis (TB-SEQ)

PI: Elisa Martró. Co-PI: Iñaki Comas
Funding agency: CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Instituto de Salud Carlos III (ISCII)
Agency code: ESP22PI06
Duration: 01/01/2022 - 31/12/2023
Video

Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Catalonia: virologic surveillance and outbreak control

PI: Marc Noguera (IrsiCaixa). Co-PI: Elisa Martró (IGTP, CIBERESP)
Funding agency: Fundació Marató de TV3
Agency code: 342/C/2021
Duration: 23/09/2021 - 22/09/2023

Pilot hepatitis C simplified screening and linkage to treatment strategy in community pharmacies (HepTestFarma)

PI: Elisa Martró
Funding agency: Becas Gilead a Proyectos de Microeliminación en Hepatitis C (5ª Convocatoria, 2022)
Agency code: GIL181
Duration: 01/01/2023 - 31/12/2024

Cost-effectiveness of a community intervention versus a healthcare-based strategy for promoting the prevention, diagnosis and treatment of hepatitis B and C in immigrants in Catalonia (HepBClink)

PI: Elisa Martró
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI19/0568
Duration: 01/01/2020 - 31/12/2024

Epidemiological modelling of SARS-CoV2 in a post-pandemic surveillance context: an open platform for mid-term scenarios and short-term predictions

PI: Clara Prats Soler
Funding agency: Fundación BBVA
Duration: 01/07/2022 - 30/06/2024

Grup de Microbiologia Clínica i Patologia Infecciosa Experimental. Ajuts de suport als grups de recerca consolidats de Catalunya

PI: Pere-Joan Cardona
Funding agency: Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)
Agency code: 2021 SGR 00931
Duration: 2022 - 2024

Enhancing Whole Genome Sequencing (WGS) and/or Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) national infrastructures and capacities to respond to the COVID-19 pandemic in the EU and EEA

PI: Cristobal Belda Iniesta (ISCIII) ; PI at IGTP: Ignacio Blanco, Pere-Joan Cardona
Funding agency: European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC)
Agency code: ECDC.HERA.2021.024
Duration: 03/09/2021 - 30/09/2022

Development of Robust and Innovative Vaccine Effectiveness (IMI-DRIVE_3)

PI: International consortium coordinated by FISABIO. PI at IGTP: Guillermo Mena, Irma Casas
Funding agency: Innovative Medicines Initiative
Duration: 15/09/2021 - 30/06/2022

Defining the best strategy for global HCV screening, linkage-to-care, education and prevention in PWID population

PI: Sabela Lens
Funding agency: Gilead Sciences, Inc (Foster City CA, EEUU) (HCV CHIME program: Conquering Hepatitis vIa Micro-Elimination)
Duration: 01/10/2018 - 30/09/2024

Screening of bloodborne viruses in the emergency department of Hospital Germans Trias i Pujol (FOCUS)

PI: RM. Morillas, E. Martró, A. Carreras, E. Negredo
Funding agency: Gilead Sciences, S.L.
Duration: 27/06/22 - 30/11/2023

Screening of bloodborne viruses in the emergency department of Hospital Germans Trias i Pujol

PI: Rosa Mª Morillas, Elisa Martró, Anna Carreres, Eugènia Negredo
Funding agency: Gilead Sciences, S.L.U.
Agency code: FOCUS Program
Duration: 27/06/2022 - 26/09/2024

Screening of bloodborne viruses in the emergency department of Hospital Germans Trias i Pujol (FOCUS)

PI: RM. Morillas, E. Martró, A. Carreras, E. Negredo
Funding agency: Gilead Sciences, S.L.
Duration: 01/02/2025 - 31/01/2025

Publicacions científiques

Publicacions destacades

Bordoy AE, Vallès X, Fernández-Náger J, Sánchez-Roig M, Fernández-Recio J, Saludes V, Noguera-Julian M, Blanco I, Martró E; Quatre Camins COVID-19 Study Group. Analysis of a large SARS-CoV-2 (Alpha) outbreak in a Catalan prison using conventional and genomic epidemiology. J Infect Dis. 2024 Apr 4:jiae161. DOI: 1093/infdis/jiae161.

Antuori A, Not A, Mesías-Gazmuri J, González V, Montoro-Fernandez M, Folch C, Saludes V, Villar M, Meroño M, Paytubi S, Alemany L, Casabona J, Martró E; SexCohort Group. High Hepatitis B Prevalence and Vaccination Needs Among Transgender Women and Men Sex Workers in Barcelona, Spain. Open Forum Infect Dis. 2024 Jul 17;11(8):ofae410. DOI: 10.1093/ofid/ofae410.

Not A, Saludes V, Gálvez M, Miralpeix A, Bordoy AE, González N, González-Gómez S, Muntané L, Reyes-Urueña J, Majó X, Colom J, Forns X, Lens S, Martró E. Usefulness of dried blood spot samples for monitoring hepatitis C treatment outcome and reinfection among people who inject drugs in a test-and-treat program. J Med Virol. 2023 Feb;95(2):e28544. DOI: 10.1002/jmv.28544

Wang-Wang JH, Bordoy AE, Martró E, Quesada MD, Pérez-Vázquez M, Guerrero-Murillo M, Tiburcio A, Navarro M, Castellà L, Sopena N, Casas I, Saludes V, Giménez M, Cardona PJ. Evaluation of Fourier Transform Infrared Spectroscopy as a First-Line Typing Tool for the Identification of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Klebsiella pneumoniae Outbreaks in the Hospital Setting. Front Microbiol. 2022 Jun 9;13:897161. DOI: 3389/fmicb.2022.897161.

Antuori A, Montoya V, Piñeyro D, Sumoy L, Joy J, Krajden M, González-Gómez S, Folch C, Casabona J, Matas L, Colom J, Saludes V, Martró E; HepCdetect II Study Group. Characterization of Acute HCV Infection and Transmission Networks in People Who Currently Inject Drugs in Catalonia: Usefulness of Dried Blood Spots. Hepatology. 2021 Aug;74(2):591-606. DOI: 1002/hep.31757.

TOTES LES PUBLICACIONS

Informació addicional

Xarxes col·laboratives

  • CIBER en Epidemiologia i Salut Pública (CIBERESP): E. Martró i V. Saludes, juntament amb el CEEISCAT (Centre d'Estudis Epidemiològics de les ITS/sida de Catalunya), pertanyen al Grup 27 del CIBERESP. El grup està liderat pel Dr. Jordi Casabona des de l'any 2007, i el liderarà E. Martró quan es jubili. Dins del CIBERESP el Grup participa en el Programa 2 "Epidemiologia, prevenció i control de les malalties transmissibles" en col·laboració amb altres col·lectius interessats en l'hepatitis viral, les ITS i la tuberculosi: Fernando González-Candelas (I2SysBio, València), Iñaki Comas (IBV-CSIC, València), Cristina Rius (Agència de Salut Pública de Barcelona), Pere-Direcció de Salut Pública de Barcelona Salut Pública-Agència de Salut Pública de Catalunya), Àngela Domínguez (Universitat de Barcelona), Laia Alemany (ICO), Juan-Carlos Galán (H. Ramón y Cajal, Madrid), Andrés Marco (Programa de Salud Penitenciaria, Institut Català de la Salut). El grup també col·labora amb investigadors d'altres àrees del CIBER:
    • CIBER en Malalties Hepàtiques (CIBEREHD): Rosa MªMorillas (Hospital Germans Trias i Pujol, Badalona), Sabela Lens i Xavier Forns (Hospital Clínic, Barcelona), Maria Buti (Hospital Vall d'Hebrón, Barcelona).
    • CIBER en Malalties Respiratòries (CIBERES): Pere-Joan Cardona (Hospital Germans Trias i Pujol, Badalona).
    • CIBER en Malalties Infeccioses (CIBERINFEC): Julián González (Hospital Clínic - ISGlobal, Barcelona), MªTeresa Tórtola (Hospital Vall d'Hebrón, Barcelona), Núria Izquierdo i Marta Massanella (Fundació IrsiCaixa, Badalona).

                     

  • Grup d'Estudi de l'Hepatitis Viral (GEHEP). Sociedad Española de Microbiología y Enfermedades Infecciosas (SEIMC): E. Martró, V. Saludes i A. Not són membres del GEHEP, i a través d'aquest grup han participat en projectes i publicacions col·laboratives amb Antonio Aguilera (Hospital Clínico Universitario de Santiago de Compostela, La Corunya), Federico García (Hospital Universitari Clínico San Cecilio, Granada; CIBERINFEC, Universidad de Victòria, Isabel Paola), Gabriel Reina Navarra (Isabel Paola), Universitat de Vic. (Hospital Virgen de la Victoria, Màlaga) entre d'altres.
  • Xarxa Nacional de Laboratoris per a la Seqüenciació Genòmica del SARS-CoV-2 (RELECOV). Des del gener de 2021, una xarxa de laboratoris espanyols coordinada per l'ISCIII (Inmaculada Casas, Centro Nacional de Microbiologia, Instituto de Salud Carlos III, Madrid) en col·laboració amb el Ministeri de Sanitat representat pel Centre de Coordinació d'Alertes i Emergències (CCAES), va ser finançada amb dues subvencions europees (ECDC/HERA 2021 Grant/2021/PHF/23776 i EU4H-2022-DGA-MS-IBA-01-02), primer per cobrir les necessitats de seqüenciació i recopilar coneixement dels virus del SARS-CoV-2 mitjançant la seva anàlisi genòmica, i després per integrar una infraestructura millorada i consolidar activitats en la vigilància rutinària del SARS-CoV-2 i la investigació de brots, en sinergia amb les autoritats de salut pública de cada CCAA amb el treball pertinent en curs a nivell nacional i internacional, per tal de millorar en última instància les mesures de preparació per a futures emergències sanitàries. E. Martró forma part del Comitè Directiu del segon projecte. Més informació

                     

  • COVIDRIVE: Una associació públicoprivada per monitorar els programes de vacunació contra la COVID-19 per a instituts de salut pública i l'efectivitat específica per marca de vacunes per a les empreses farmacèutiques. Aquesta xarxa prové de la xarxa DRIVE sobre el virus de la grip i s'ha ampliat per incloure el virus respiratori sincitial i altres patògens respiratoris (Id.DRIVE). Més informació

         

  • En l'àmbit de la resistència als antimicrobians, el grup participa en RedLabRA (La Red de Laboratorios para la Vigilancia de Microorganismos Resistentes, Instituto de Salud Carlos III) i Conexión-AMR del CSIC, actualment format per 94 grups de recerca independents. Més informació

Els membres del grup també són membres de les següents societats científiques nacionals i internacionals: Societat Catalana de Biologia (SCB), Sociedad Española de Microbiología y Enfermedades Infecciosas (SEIMC), Sociedad Española de Virología (SEV), Societat Española de Epidemiología (SEE) i Societat Europea de Microbiologia Clínica i Malalties Infeccioses (ECCMID).

Tesis doctorals

Title: Micro-elimination of hepatitis B and C in vulnerable populations through new strategies for the promotion of education, screening and treatment
Author: Anna Not Gari
Director: Elisa Martró
University: Universitat Autònoma de Barcelona (UAB)
Date of defense: 18/10/2024

Title: Feasibility and acceptability of new models of hepatitis B care among African populations
Author: Camila Picchio (ISGlobal)
Directors: Jeffrey V. Lazarus, Elisa Martró
University: Universitat de Barcelona (UB)
Date of defense: 16/11/2023

Title: Improving the diagnosis and molecular characterization of viremic infection by the Hepatitis C virus in people who inject drugs
Author: Adrián Antuori (HUGTiP)
Directors: Elisa Martró, Verónica Saludes
University: Universitat Autònoma de Barcelona (UAB)
Date of defense: 03/2022

Innovació 

En el camp de l'hepatitis C, la Dra. Martró és un investigadora reconeguda tant a nivell nacional com internacional en l'ús de mostres de sang seca (DBS) i proves moleculars al punt d'atenció per primera vegada a Espanya, pilotant nous models d'atenció basats en el diagnòstic descentralitzat i la vinculació simplificada a l'atenció i el tractament. L'activitat de recerca del grup ha donat lloc a diversos acords amb la indústria del diagnòstic i la farmacèutica, i també a activitats de transferència a la salut pública, com ara la contribució a la implementació d'aquestes noves solucions diagnòstiques i estratègies de prova en el nou protocol "Protocol de diagnòstic i tractament del virus de l'hepatitis C per a persones consumidores de drogues" (Agència de Salut Pública de Catalunya), i ser citat com a bons exemples dins de la "Guia de cribratge de la infecció per VHC" (Ministeri de Salut, edicions 2020 i 2022).

A més, les noves estratègies diagnòstiques i models d'atenció s'han inclòs en diverses recopilacions internacionals de bones pràctiques:

  1. "Hepatitis C: new models of care for drugs services" per l’European Monitoring Center for Drugs and Drug Addiction - EMCDDA- 2019
  2. "Case stories" per Cepheid 2022
  3. "Stories to Inspire" per ACHIEVE Coalition 2023, que es va presentar en un acte sobre l'eliminació de l'hepatitis al Parlament Europeu.  Descarrega el pdf
  4. "Barriers and solutions to increasing access to point-of-care HCV testing" (INHSU, 2023)

Finalment, la Dra. Martró també ha participat en guies de pràctica clínica sobre el cribratge d'hepatitis com ara "Recomanacions per al diagnòstic complet de l'hepatitis viral crònica en una sola extracció analítica" publicades per diverses societats (AEEH, GEHEP, SEPD, SEIMC, AEHVE) i també a Crespo J, et al. Gastroenterol Hepatol 2023;46. A través d'acords amb la indústria farmacèutica (Programa FOCUS, Gilead Sciences), la Dra. Martró també ha codirigit la implementació de millores en el cribratge i la vinculació al tractament de pacients amb hepatitis C dins de l'Hospital Universitari Germans Trias i Pujol.

La Dra. Martró va ser convidada a participar en el desenvolupament del conjunt d'eines basat en web "Dried blood spot (DBS) testing for Hepatitis C" 2021 promogut per la Xarxa Internacional sobre Salut i Hepatitis en Usuaris de Substàncies (INHSU). A més, Martró i Saludes, amb el suport d'Abbvie, van crear una guia pas a pas en PDF i un vídeo amb instruccions per a la recollida de mostres de sang seca, que incorpora l'experiència en la recollida d'aquestes mostres mínimament invasives adquirida a través de diversos projectes des del 2015, inclòs l'ús de materials i controls de qualitat adequats, que es van posar a disposició pública el 2022.

Impulsada per la recerca del grup, el 2022 es va implementar a Catalunya una vigilància genòmica de la tuberculosi basada en la població (estratègia TB-SEQ) com a part del Programa de Control de la Tuberculosi de la Generalitat de Catalunya, donant lloc a un programa pioner al país. Els clústers de transmissió rellevants, definits per les autoritats de salut pública com aquells que impliquen soques multirresistents, de ràpid creixement, casos pediàtrics o amb una àmplia dispersió geogràfica, són discutits per un "Grup d'experts en WGS aplicat a la Salut Pública" multidisciplinari, que es va consolidar el 2024 i inclou agents de Salut Pública i professionals de la seqüenciació. Les cadenes de transmissió dins dels clústers genòmics rellevants es disseccionen mitjançant l'anàlisi de xarxes median-joining, complementada amb metadades epidemiològiques. Aquesta forma innovadora de treball compartit ajuda a identificar les causes de la transmissió i les relacions entre casos, permetent mesures de control personalitzades.

Divulgació 

El grup ha participat en diverses activitats educatives, algunes de les quals estan disponibles en línia:

  • Per al Dia Mundial de la Tuberculosi (24/03/2025), E. Martró i V. Saludes van ser convidades a participar en un taller organitzat per l'Hospital Universitari Mútua de Terrassa, on van impartir una xerrada sobre l'estratègia d'epidemiologia genòmica TB-SEQ.
  • E. Martró va participar a "Els Dijous de Salut Pública" (27/02/2025), organitzat pel Departament de Salut i obert a totes les persones interessades, on va parlar sobre "Millorar l'equitat en el diagnòstic de l'hepatitis C. La utilitat de les tècniques actuals de cribratge comunitari". Més informació
  • E. Martró va participar al seminari web de formació "Virus de l'Hepatitis C en poblacions especials i vulnerables", una activitat conjunta organitzada per l'ESCMID (grup ESGVH) i la SEIMC (grup GEHEP), disponible al SEIMC-Campus, amb una ponència titulada "Estratègies de cribratge en poblacions vulnerables: Quan el laboratori surt del laboratori?" (25/11/2024). Més informació
  • E. Martró també va participar a les XXVIII Jornades Internacionals sobre Tuberculosi (12/11/2024), organitzades per la Fundació uiTB, amb la presentació "Reptes i avenços de l'estratègia d'epidemiologia genòmica de la tuberculosi a Catalunya (TB-SEQ)". Més informació
  • E. Martró va participar a la xarxa temàtica "Divendres de recerca en addiccions a Catalunya", organitzada pel Departament de Salut, amb la xerrada "Nous reptes en hepatitis C: microeliminació en persones que s'injecten drogues" (11/10/2024). Més informació
  • A. E. Bordoy va ser convidat a participar a les XIV Jornades d'Enfermetats Emergents organitzades per la Fundació uiTB (11/06/2024), amb la ponència "Breu història i dinàmica actual del SARS-CoV-2". Més informació
  • V. Saludes va ser convidada pel Col·legi de Biòlegs de Catalunya a fer un seminari web sobre l'"Estratègia d'epidemiologia genòmica de la tuberculosi a Catalunya (TB-SEQ)" (17/04/2024). Més informació
  • E. Martró va ser convidada per la Viral Hepatitis Prevention Board (VHPB) a participar a la reunió tècnica "Addressing Viral Hepatitis Among Europe's Migrant and Refugee Population: lessons learnt and the way forward", celebrada a Anvers (Bèlgica) els dies 26 i 27 de març de 2024, on va oferir la ponència "Point-of-care testing for hepatitis B and C in migrants in diverse community centres". L'informe resultant de la reunió està en procés de publicació com a article d'opinió experta a la revista Journal of Migration and Health.
  • V. Saludes va ser convidada per la Societat Catalana de Malalties Infeccioses i Microbiologia Clínica per fer una xerrada sobre "Identificació bacteriana en endocarditis infecciosa mitjançant seqüenciació nanopore del gen 16S rRNA" (21/03/2024).
  • E. Martró també va participar al curs de formació de postgrau "Diseases of poverty in the modern era", organitzat per la European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID), amb la ponència "Elimination of hepatitis B and C in people with substance use disorder: Is it possible?" (1-2/02/2024), disponible a l'ESCMID Academy.
  • Diversos membres del grup (Verónica Saludes, Alèxia Paris, Maria Piñana, Antoni E. Bordoy i D. Panisello) participen en el programa anual "Joves per la Medicina (Science Academy)" realitzant pràctiques de laboratori en genètica per a estudiants de batxillerat als hospitals, organitzat per la Fundació Catalunya La Pedrera.
  • E. Martró va participar al tercer episodi del pòdcast de l'IGTP Un bri de ciència, sobre l'hepatitis viral, que es va llançar amb motiu del Dia Mundial de l'Hepatitis 2023.

Molts dels projectes del grup es basen en la implicació comunitària: en provar nous models d'atenció per a les hepatitis víriques en poblacions vulnerables, s'han inclòs líders comunitaris i associacions de la societat civil, i s'han realitzat sessions educatives en diversos entorns amb l'objectiu d'apoderar les poblacions migrants (HepCdetect II, HepClink, HepBClink). Agents de salut comunitaris procedents de països endèmics pel VHC/VHB han estat formats per poder realitzar proves ràpides i la recollida de mostres de sang seca (DBS) dins les seves pròpies comunitats migrants, en el seu propi idioma. Aquests agents han educat les comunitats migrants sobre les hepatitis víriques amb una eina en format tauleta (Heparjoc), en col·laboració amb l'Equip de Salut Pública i Comunitària (ESPIC, VHIR). També han avaluat l'acceptabilitat i la satisfacció dels pacients durant la prova pilot de diversos nous models d'atenció. A més, han col·laborat amb diverses ONG (StopSida, Gais Positius, gTt-VIH, Àmbit) que donen suport a persones amb diversitat de gènere, i han format voluntaris comunitaris d'aquestes entitats per dur a terme proves ràpides, recollida de mostres DBS i assessorament pre- i postprova.

Notícies

- Conferències, Projectes,

Investigadors del projecte Sextra visiten l’IGTP en el marc del Programa CORE

Del 4 al 7 de febrer, l'IGTP va acollir una trobada d'investigadors del "Hub de recherche communautaire de Can Ruti", una xarxa que forma part del programa CARE de l’IGTP, i en el qual hi participen CEEISCAT-IGTP, Coalition Plus i la Fundació Sida i Societat. La reunió va servir per consolidar sinergies entre els equips, enfortint la col·laboració internacional en recerca sobre VIH i ITS.

L’IIS IGTP obté més de 6,5 milions d’euros en el marc de l’Acción Estrategica en Salud 2024

L'IIS IGTP ha obtingut un finançament total de 6.518.867€ per a diversos projectes de recerca i contractes d'investigadors en les convocatòries de l’Acción Estretegica en Salud 2024.

+ Notícies