GCAT contribuye a identificar una nueva región genética relacionada con la gravedad de la COVID-19 y a caracterizar extensamente una inversión cromosómica
Severe Covid-19 GWAS Group, el grupo que dio a conocer el primer análisis genético del virus a principios de la pandemia (NEJM, 2020), presenta ahora los nuevos resultados de un metaanálisis GWAS extendido de una cohorte bien caracterizada de 3.260 pacientes con COVID-19 con fallos respiratorios y 12.483 controles de población en Italia, España, Noruega y Alemania/Austria, publicados en Human Molecular Genetics. El estudio partía de la base que, dado el fenotipo clínico altamente variable de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), es importante un análisis más profundo de la contribución genética del huésped en la COVID-19 grave para mejorar nuestra comprensión de los mecanismos subyacentes de la enfermedad.
El proyecto GCAT del IGTP, dirigido por el Dr. Rafael de Cid -uno de los coautores principales de este artículo-, da a conocer en este estudio un análisis estratificado extendido basado en la edad, el sexo y la gravedad de la enfermedad y un análisis específico de los haplotipos del cromosoma Y, el antígeno leucocitario humano (HLA) y el peptidoma del SARS-CoV-2. Los resultados del trabajo identificaron un nuevo loci (posición de un gen en un cromosoma) en 19q13.33, incluido el gen NAPSA, que se expresa principalmente en las células alveolares responsables del intercambio de gases en el pulmón como candidato implicado en el fenotipo grave. Además, tienen una fuerte asociación en 17q21.31, un polimorfismo de inversión grande altamente pleiotrópico (un gen con más de un efecto, que afecta a múltiples características del fenotipo).
Este trabajo completa el trabajo recientemente publicado por el consorcio internacional COVID-19 Host Genetic Initiative, A first update on mapping the human genetic architecture of COVID-19, en el que también participa GCAT agregando una nueva capa de complejidad a la base genética del fenotipo clínico altamente variable de la enfermedad por coronavirus de 2019 (COVID-19), explorando regiones específicas del genoma.
Referencia
Degenhardt F, et al. Detailed stratified GWAS analysis for severe COVID-19 in four European populations. Human Molecular Genetics. 2022 Nov 28;31(23):3945-3966. DOI: 10.1093/hmg/ddac158. PMID: 35848942; PMCID: PMC9703941.