Un nuevo estudio con la cohorte GCAT analiza los rasgos pigmentarios y su relación con las enfermedades

Investigadores del proyecto GCAT'Genomes for Life del IGTP han analizado la base genética de 13 rasgos pigmentarios y su asociación con enfermedades. El trabajo se ha publicado este mes en la revista Genes.

Los rasgos pigmentarios, determinados genéticamente, han sido estudiados en gran parte por GWAS sobre todo en cohortes de ascendencia caucásica del norte de Europa. No obstante, hay una falta de información notable en la población del sur de Europa. Entender las bases genéticas de la adaptación del color de la piel a diferentes poblaciones tiene muchas implicaciones para la evolución humana y también en la práctica de la medicina.

Mediante la cohorte del GCAT, Xavier Farré y Natalia Blay, los dos primeros autores del estudio, junto con Betty Cortés, han construido una estrategia de análisis integral que ha conducido a la identificación de enfermedades asociadas a rasgos pigmentarios en un total de cerca de 20.000 sujetos catalanes, explorando un total de 177 CIE-9 diagnósticos. Complementariamente, el análisis del genoma analizando más de 10 millones de variantes, incluidas variantes estructurales, utilizando Polygenic Risk Scores, reveló la genética compartida entre enfermedades y determinantes de la pigmentación, identificando dos nuevos genes implicados en el color de la piel.

“Hemos observado que un fototipo de piel clara está fuertemente asociado al cáncer de piel no melanoma y otras dermatosis. Además, se confirmó mediante la aproximación de PRS la base genética común con algunas enfermedades de la piel y los ojos como el melanoma, el cáncer de piel no melanoma y el carcinoma basocelular. Sin embargo, un fototipo más oscuro se vio asociado a una mayor prevalencia de vitíligo y cataratas. El estudio también identificó un vínculo con enfermedades comunes como la obesidad y la hipertensión” explica Rafael de Cid, principal autor del estudio.

Los análisis genéticos revelaron 37 loci de riesgo asociados con la mayoría de rasgos pigmentarios, de los cuales 16 genes van asociados significativamente con al menos dos rasgos. Algunos de ellos ampliamente confirmados, tales como MC1R, HERC2, OCA2, TYR, TYRP1, SLC45A2 y la identificación de tres nuevos candidatos C1QTNF3, C1QTNF3-AMACR y LINC02876, con un importante potencial regulador: un long-RNA no codificante (LINC028 y un non-mediated-decay RNA (NMD) (C1QTNF3-AMACR) que define un putativo hotspot de regulación de los rasgos pigmentarios.

Este estudio revela la base genética de los rasgos pigmentarios en la cohorte GCAT, siendo hasta el momento la mayor población sudeuropea analizada, ampliando el trabajo anterior realizado principalmente en cohortes de ascendencia caucásica del norte de Europa e incluyendo un espectro más amplio enfermedades que los estudios anteriores. "Nuestros resultados ponen de manifiesto la importancia de incorporar información poblacional para adaptar los enfoques de atención personalizada para gestionar el riesgo diferencial en la población general, siendo de gran importancia en las poblaciones mixtas modernas. La genética del color de la piel, como indicador de la funcionalidad de la piel, podría ayudar a la detección de enfermedades en poblaciones mixtas", concreta de Cid.

Las investigaciones posteriores sobre cohortes multi-ascendencia podrán extraer conclusiones definitivas sobre la asociación entre las características pigmentarias y la prevalencia de enfermedades en distintas poblaciones.

Referencia

Farré X, Blay N, Cortés B, Carreras A, Iraola-Guzmán S, de Cid R. Skin Phototype and Disease: A Comprehensive Genetic Approach to Pigmentary Traits Pleiotropy Using PRS in the GCAT Cohort. Genes (Basel). 2023 Jan 5;14(1):149. DOI: 10.3390/genes14010149. PMID: 36672889; PMCID: PMC9859115.