Presentació
Aquest grup de recerca té com a objectiu identificar els mecanismes i les vies moleculars que afavoreixen la mort cel·lular programada i la progressió del càncer mitjançant tecnologies genòmiques punteres, centrant-se principalment en el càncer colorectal. La seva recerca també s'estén a altres tipus de càncer i malalties genètiques.
Els interessos actuals de l'equip es troben en el desenvolupament d'eines tècniques i bioinformàtiques que facilitin el tractament i la interpretació de dades genòmiques i epigenòmiques, i que cubreixin el buit que existeix entre les tecnologies d'última generació i les aplicacions clíniques. A aquest efecte, han desenvolupat aplicacions en Internet i eines que faciliten la gestió i l'accés a dades genòmiques. Per a l'estudi de la tumorigènesi colorectal i els processos de diferenciació cel·lular s'utilitzen mostres de persones i models in vitro amb la finalitat de crear marcs de referència i models de treball que permetin elucidar els mecanismes que controlen la formació de neoplàsies malignes.
El grup de recerca també ha desenvolupat nous mètodes per a extreure informació genètica i epigenètica, i ha establert una spin-off per a traslladar aquests avanços en tecnologies genòmiques i epigenòmiques a la pràctica clínica. Finalment, el grup ha desenvolupat una tècnica per a identificar el perfil epigenètic del «genoma fosc» amb la finalitat de determinar les propietats funcionals d'elements repetitius específics i la seva contribució a la regulació del genoma en cèl·lules de càncer de còlon.
Paraules clau: Càncer colorectal, epigenètica, biomarcadors, perfil molecular integrador, evolució tumoral.
_1685691852.jpg)
Líder/s de grup
- Miguel Ángel Peinado
Miguel Ángel Peinado
Miguel A. Peinado té una llicenciatura en Biologia (Universitat de Barcelona) i una llarga trajectòria de recerca a l'Hospital Clínic (tesi de màster, 1985-1986), Hospital de Sant Pau (doctorat, 1986-1989), California Inst. Biol. Res (postdoc, 1990), IRO (contracte de reincorporació, 1992) i com a investigador principal a l'IRO (1992-2005), IDIBELL (2005-2007), IMPPC (2007-2015) i IGTP (2016-). També ha tingut responsabilitats de gestió com a director de Departament a l'IRO, coordinador científic a l'IMPPC i subdirector a l'IGTP. Actualment, Peinado és codirector del Programa de Recerca Translacional en Càncer (CARE) de l'IGTP.
MA Peinado ha participat en més de 25 projectes de recerca i ha publicat més de 140 articles científics, incloent-hi revistes multidisciplinàries de prestigi com Nature, Science, NEJM i PNAS, i revistes especialitzades en els camps de la Genètica (Nat Genet, Nucl Acids Res, Genome Res, etc.) i el Càncer (JNCI, Cancer Res, J Clin Oncol, Cancer Cell, etc.). MA Peinado també ha liderat contractes de recerca amb la indústria i és coinventor de cinc patents. Des de 2015, és director científic (CSO) d'Aniling, una empresa emergent dedicada a accelerar la transferència dels avenços en Epigenètica a la Medicina mitjançant el desenvolupament de tecnologies NGS.
Contacte: mpeinado(ELIMINAR)@igtp.cat
ORCID: 0000-0002-4090-793X
Línies de recerca
L'objectiu principal d'aquest grup de recerca és la caracterització dels mecanismes moleculars que sustenten els programes cel·lulars i la identificació de marcadors moleculars amb aplicació clínica. Els temes específics que actualment s'estan desenvolupant al laboratori inclouen:
- Arquitectura de la cromatina en la diferenciació cel·lular i el càncer
- El paper dels elements repetits en l'estructura i funció del genoma
- Recerca orientada clínicament sobre els canvis epigenètics implicats en el càncer humà
Projectes actius
Enabling personalized colorectal cancer management by coupling unified genetic and epigenetic testing to organoid-based treatment screening (Spot & Hit)
PI: L. Coll
Funding agency: Ministerio de Ciencia e Innovación (MCINN)
Agency code: CPP2021-008602
Duration: 2022 - 2025
Proyecto CPP2021-008602 financiado por:
Proyecto CPP2021-008602 financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/ PRTR
Integration of specific and interspersed genetic and epigenetic signals as a multi-tool to type colorectal cancer (GEALUS)
PI: MA Peinado
Funding agency: Ministerio de Ciencia e Innovación (MCINN)
Agency code: PID2021-124315OB-I00
Duration: 2022 - 2025
Past projects
DEEP-GEUS: a new Artificial Intelligence assisted integrative genomic diagnostics system of Chronic Lymphocytic Leukemia
Funding agency: Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI)
Agency code: IDI-20191104
Duration: 2019 - 2023
Germline predisposition to serrated polyposis syndrome: functional charaterization of candidate genes by CRISPR-CAS and organoid modeling
PI: S. Castellví
Funding agency: Fundació Marató de TV3
Agency code: 2019 2020008
Duration: 2021 - 2023
Use of artificial intelligence and systems biology for diagnosis and personalized risk assessment for inherited kidney diseases, focusing on Alport Syndrome
PIs: R Torra, MA Peinado, A Ortiz, M Vallverdú
Funding agency: Fundació Marató de TV3
Agency code: 22/C/2020
Duration: 2021 - 2023
Publicacions científiques
Publicacions destacades
Mallona I, Díez-Villanueva A, Martín B, Peinado MA. Chainy: an universal tool for standardized relative quantification in real-time PCR. Bioinformatics. 2017 May 1;33(9):1411-1413. DOI: 10.1093/bioinformatics/btw839.
Jordà M, Díez-Villanueva A, Mallona I, Martín B, Lois S, Barrera V, Esteller M, Vavouri T, Peinado MA. The epigenetic landscape of Alu repeats delineates the structural and functional genomic architecture of colon cancer cells. Genome Res. 2017 Jan;27(1):118-132. DOI: 10.1101/gr.207522.116.
Barrera V, Peinado MA. Evaluation of single CpG sites as proxies of CpG island methylation states at the genome scale. Nucleic Acids Res. 2012 Dec;40(22):11490-8. DOI: 10.1093/nar/gks928.
Rodriguez J, Muñoz M, Vives L, Frangou CG, Groudine M, Peinado MA. Bivalent domains enforce transcriptional memory of DNA methylated genes in cancer cells. Proc Natl Acad Sci USA. 2008 Dec 16;105(50):19809-14. DOI: 10.1073/pnas.0810133105.
Wang Y, Jorda M, Jones PL, Maleszka R, Ling X, Robertson HM, Mizzen CA, Peinado MA, Robinson GE. Functional CpG methylation system in a social insect. Science. 2006 Oct 27;314(5799):645-7. DOI: 10.1126/science.1135213.
Rodriguez J, Frigola J, Vendrell E, Risques RA, Fraga MF, Morales C, Moreno V, Esteller M, Capellà G, Ribas M, Peinado MA. Chromosomal instability correlates with genome-wide DNA demethylation in human primary colorectal cancers. Cancer Res. 2006 Sep 1;66(17):8462-9468. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-06-0293.
Frigola J, Song J, Stirzaker C, Hinshelwood RA, Peinado MA, Clark SJ. Epigenetic remodeling in colorectal cancer results in coordinate gene suppression across an entire chromosome band. Nat Genet. 2006 May;38(5):540-9. DOI: 10.1038/ng1781.
Risques RA, Moreno V, Ribas M, Marcuello E, Capellà G, Peinado MA. Genetic pathways and genome-wide determinants of clinical outcome in colorectal cancer. Cancer Res. 2003 Nov 1;63(21):7206-14. PMID: 14612515.
González-García I, Moreno V, Navarro M, Martí-Ragué J, Marcuello E, Benasco C, Campos O, Capellà G, Peinado MA. Standardized approach for microsatellite instability detection in colorectal carcinomas. J Natl Cancer Inst. 2000 Apr 5;92(7):544-9. DOI: 10.1093/jnci/92.7.544.
Arribas R, Capellà G, Tórtola S, Masramon L, Grizzle WE, Perucho M, Peinado MA. Assessment of genomic damage in colorectal cancer by DNA fingerprinting: prognostic applications. J Clin Oncol. 1997 Oct;15(10):3230-40. DOI: 10.1200/JCO.1997.15.10.3230.
Notícies
La recerca en càncer és la protagonista d’un nou episodi del pòdcast 'Un bri de ciència'
Coincidint amb el Dia Mundial contra el Càncer, el pòdcast de l'IGTP dedica el seu vuitè episodi a la recerca en aquest conjunt de malalties, posant el focus en el programa CARE, una iniciativa que integra a professionals de salut del Campus Can Ruti per compartir coneixements i eines.
Programa Translacional de Recerca en Càncer II Workshop: un hub per a la recerca i la col·laboració
El segon CARE Workshop, celebrat el 9 i 10 d'octubre, va reunir més de 70 investigadors de la comunitat de recerca en càncer del Campus biomèdic de Can Ruti durant dos dies d'intercanvi científic. L'esdeveniment va servir com a plataforma per compartir les investigacions sobre càncer que s'estan desenvolupant al Campus i per fomentar connexions més estretes entre els investigadors.
Contacte
(+34) 93 554 3057
Més enllaços
Eines online i informació del grup · Spin-off Aniling · Aquest grup és un partner de BIB