Presentación
Este grupo de investigación estudia tumores del sistema nervioso periférico, otros tumores originados en la cresta neural y sarcomas relacionados. Muchos de estos tumores se forman en pacientes que presentan enfermedades genéticas con predisposición al cáncer, como la neurofibromatosis de tipo 1 o el retinoblastoma hereditario, pero también se dan otros casos.
Las competencias del grupo son los análisis genómicos y de biología integrativa de estos tumores y la generación de nuevos modelos in vitro/in vivo para establecer su patogenia molecular e identificar nuevos tratamientos para trasladar todos estos conocimientos a la práctica clínica. El equipo recopila información genómica y epigenómica de distintos tipos, secuenciación del genoma completo, secuenciación del ARN, etc., de tejidos tumorales, modelos multicelulares y unicelulares, e integra todos estos datos mediante un análisis bioinformático exhaustivo y detallado. Esta información hace posible el desarrollo de nuevas ideas e hipótesis que se pueden evaluar experimentalmente en células primarias y modelos celulares, tanto in vitro como in vivo, en particular, mediante iPSC y modelos en 3D de células de la cresta neural.
El grupo de investigación también desarrolla análisis genómicos para facilitar la atención sanitaria a pacientes con un riesgo elevado de desarrollar tumores, por ejemplo, mediante secuenciación de lecturas largas aplicada a biopsias mínimas o líquidas. El grupo forma parte del programa CARE del IGTP y participa en el Centro de Referencia en Facomatosis (CSUR) del HGTiP-ICO. Este centro mantiene una estrecha colaboración con diferentes asociaciones de pacientes regionales e internacionales.
Palabras clave: tumores del sistema nervioso periférico, neurofibroma, tumores malignos de la vaina del nervio periférico, sarcomas de partes blandas, neurofibromatosis de tipo 1, genómica, iPSC, modelos en 3D, cresta neural.
Líder/es de grupo
- Eduard Serra Arenas, PhD
Eduard Serra Arenas, PhD
Eduard Serra es doctor en biología por la Universidad de Barcelona (2001). Realizó formación postdoctoral en el Molecular Sciences Institute en Berkeley, CA (EE.UU.), de 2001 a 2004, y en el Centro de Genética Molecular y Médica-IDIBELL, Barcelona, de 2005 a 2006. En 2006 obtuvo un contrato de investigador del FIS e inició su grupo de investigación centrado en la enfermedad de las neurofibromatosis y el cáncer hereditario. En 2009 se unió al Instituto de Medicina Predictiva y Personalizada del Cáncer (IMPPC, que se convirtió en IGTP en 2016).
La investigación del laboratorio del Dr. Serra se centra en el estudio de tumores asociados con la NF1, en particular aquellos que surgen en el sistema nervioso periférico (SNP), estudiando su desarrollo, composición, progresión y posibles terapias y manejo. Sus niveles de estudio incluyen el análisis genómico y de biología integrativa y la generación y uso de modelos celulares, incluidas células madre pluripotentes inducidas derivadas de pacientes (iPSC).
Contacto: eserra(ELIMINAR)@igtp.cat
ORCID: 0000-0003-2895-9857Bernat Gel, líder de grupo emergente
Bernat Gel es informático de formación con un máster en Computación de Altas Prestaciones. Trabajando como bioinformático y científico de datos en investigación del cáncer desde 2006, en 2014 obtuvo su doctorado en Bioinformática en la Universitat Politècnica de Catalunya. Trabaja en el IGTP (y en el antiguo IMPPC) desde 2011, liderando las tareas de bioinformática y análisis de datos del Grupo de Cáncer Hereditario.
Bernat es el líder de grupo emergente del grupo de Genómica Traslacional y Bioinformática del Cáncer. El grupo integra genómica de alto rendimiento, análisis de célula única y nuevas tecnologías de secuenciación de lecturas largas con un claro enfoque traslacional para desarrollar nuevas herramientas y estrategias para el diagnóstico y manejo de múltiples tumores raros. Actualmente, el laboratorio trabaja en tumores del sistema nervioso periférico relacionados con la NF1, otros sarcomas de tejidos blandos y algunos tumores pediátricos.
Contacte: bgel(ELIMINAR)@igtp.cat
ORCID: 0000-0001-8878-349X
Equipo
Líder de grupo emergente, bioinformático
Bernat Gel Moreno, PhD(ELIMINAR)
Investigadora asociada
Meritxell Carrió Llach, PhD(ELIMINAR)
Investigadora de postdoctorado, bioinformática
Miriam Magallón Gallego, PhD(ELIMINAR)
Investigadora de postdoctorado
Helena Mazuelas Gallego, PhD(ELIMINAR)
Estudiante de doctorado
Itziar Uriarte Arrazola(ELIMINAR)
Líneas de investigación
La investigación realizada por el grupo abarca cuatro áreas, aprovechando tanto las capacidades de laboratorio húmedo como seco.
Genómica del cáncer y biología integrativa de los tumores del sistema nervioso periférico, otros tumores derivados de la cresta neural y sarcomas
El grupo realiza análisis genómicos a diferentes niveles (genómica, transcriptómica, epigenómica) y utiliza diferentes tipos de materiales (tumores primarios, líneas celulares primarias, tipos celulares seleccionados, modelos in vitro e in vivo, células iPS, etc.) para investigar la formación, desarrollo y diseminación de tumores, integrando toda esta información mediante bioinformática.
Modelos basados en células primarias y iPSC para cáncer y regeneración
El equipo investiga la identidad y el comportamiento del tipo celular que origina tumores benignos del sistema nervioso periférico (SNP) asociados a las neurofibromatosis (NFs). Lo hacen generando células iPS directamente a partir de células de tumores benignos asociados a la NF y desarrollando modelos de tumoroides, a partir de células iPS o directamente de tumores. También quieren usar células iPS para comprender la formación de células del SNP y utilizarlas con fines de regeneración.
Patogénesis molecular de la neurofibromatosis tipo 1
Buscan la base molecular de la neurofibromatosis tipo 1 y los rasgos clínicos asociados investigando las presentaciones clínicas de los pacientes atendidos en el CSUR Phakomatosis del HUGTiP-ICO u otros entornos clínicos, o utilizando modelos que faciliten enfoques experimentales.
Genómica del cáncer aplicada para la traslación a la clínica
Junto con el Programa de Cáncer Hereditario del ICO, trabajan constantemente para mejorar el diagnóstico genético del cáncer hereditario. El grupo intenta desarrollar estrategias rentables que permitan identificar e interpretar de manera eficiente las mutaciones causantes de enfermedades utilizando técnicas genómicas y bioinformáticas.
Proyectos activos
NF1-Associated Peripheral Nerve Sheath Tumors at Single-Cell Resolution: Heterogeneity, Tumor Growth, and Malignant Progression
PI: Eduard Serra
Funding agency: Department of Defense (DOD), USA
Agency code: NF200051
Duration: 01/07/2021 - 30/06/2024
More information
Nuevas aproximaciones de genómica traslacional para el diagnóstico y el manejo de tumores malignos de la vaina de los nervios periféricos y otros sarcomas
PI: Bernat Gel
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI23/00583
Duration: 1/01/2024 - 31/12/2026
Nanopore-based genomic analysis of minimally invasive biopsies of ANNUBP and MPNST for better diagnostics and management
PI: Bernat Gel
Funding agency: Children's Tumor Foundation (CTF)
Agency code: Clinical Research Award (CRA)
Duration: 17/12/2023 - 16/12/2025
More information
Análisis genómico basado en secuenciación por nanoporos de biopsias mínimamente invasivas de ANNUBP y MPNST para un mejor diagnóstico y manejo clínico
PI: Bernat Gel
Funding agency: Fundación Proyecto Neurofibromatosis
Duration: 27/12/2023 - 26/12/2025
Combining the inhibition of the Ras/MAPK pathway and the activation of the cAMP/PKA pathway as a therapeutic strategy for cutaneous neurofibroma
PI: Eduard Serra; co-PI Piotr Topilko
Funding agency: Neurofibromatosis Therapeutic Acceleration Program (NTAP)-Johns Hopkins University
Agency code: 2005932384
Duration: 01/04/2023 - 31/03/2026
Testing new therapeutic strategies for benign and malignant tumors of the peripheral nervous system associated to Neurofibromatosistype 1 (NF1)
PI: Eduard Serra
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI23/00422
Duration: 1/01/2024 - 31/12/2026
Identification of drugs targeting epigenetic regulators in an iPSC-based 3D MPNST model
PI: Eduard Serra; Co-PI: Marc Ferrer (NCATS (NIH))
Funding agency: Children's Tumor Foundation (CTF)
Agency code: Drug Discovery Initiative Award
Duration: 01/07/2023 - 30/06/2024
Estudio del cáncer secundario en pacientes con retinoblastoma hereditario; diseño de una estrategia basada en biopsia liquida para un diagnóstico temprano y adecuado seguimiento - proyecto RET-LB
PI: Eduard Serra
Funding agency: Fundación FEDER para la investigación de enfermedades raras
Duration: 1/06/2023 - 31/12/202
Nuevas combinaciones terapéuticas y estrategias de ensayos co-clínicos a tiempo real para MPNSTs en niños y adultos con NF1
PIs: Conxi Lázaro (ICO-IDIBELL); Héctor Salvador (Hospital St. Joan de Déu), Eduard Serra (coordinator, IGTP)
Funding agency: Fundación Proyecto Neurofibromatosis
Agency code: 2005932384
Duration: 27/01/2024 - 26/01/2026
Past projects
Impact of cellular, genetic and epigenetic heterogeneity in the progression and treatment of peripheral nervous system tumors associated to Neurofibromatosis type 1
PI: Bernat Gel, Eduard Serra
Funding agency: Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)
Agency code: PI20/00228
Duration: 2021 - 2023
Testing the Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumor vulnerability to precision therapies directed to recurrent genomic alterations
PI: Eduard Serra
Funding agency: Fundació La Marató de TV3
Agency code: 51/C/2019
Duration: 2020 - 2023
Caracterización de la composición y heterogeneidad celular de los tumores del sistema nervioso periférico asociados a la neurofibromatosis de tipo 1 a partir de análisis de célula única
PI: Bernat Gel, Eduard Serra
Funding agency: Fundación Proyecto Neurofibromatosis
Duration: 2020 - 2022
Publicaciones científicas
Publicaciones destacadas
Mazuelas H, Magallón-Lorenz M, Uriarte-Arrazola I, Negro A, Rosas I, Blanco I, Castellanos E, Lázaro C, Gel B, Carrió M, Serra E. Unbalancing cAMP and Ras/MAPK pathways as a therapeutic strategy for cutaneous neurofibromas. JCI Insight. 2024 Jan 4;9(3):e168826. DOI: 10.1172/jci.insight.168826.
Magallón-Lorenz M, Terribas E, Ortega-Bertran S, Creus-Bachiller E, Fernández M, Requena G, Rosas I, Mazuelas H, Uriarte-Arrazola I, Negro A, Lausová T, Castellanos E, Blanco I, DeVries G, Kawashima H, Legius E, Brems H, Mautner V, Kluwe L, Ratner N, Wallace M, Fernández-Rodriguez J, Lázaro C, Fletcher JA, Reuss D, Carrió M, Gel B, Serra E. Deep genomic analysis of malignant peripheral nerve sheath tumor cell lines challenges current malignant peripheral nerve sheath tumor diagnosis. iScience 2023 31;26(2):106096. DOI: 10.1016/j.isci.2023.106096.
Mazuelas H, Magallón-Lorenz M, Fernández-Rodríguez J, Uriarte-Arrazola I, Richaud-Patin Y, Terribas E, Villanueva A, Castellanos E, Blanco I, Raya Á, Chojnacki J, Heyn H, Romagosa C, Lázaro C, Gel B, Carrió M, Serra E. Modeling iPSC-derived human neurofibroma-like tumors in mice uncovers the heterogeneity of Schwann cells within plexiform neurofibromas. Cell Rep. 2022 Feb 15;38(7):110385. DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110385.
Moreno-Cabrera JM, Del Valle J, Castellanos E, Feliubadaló L, Pineda M, Brunet J, Serra E, Capellà G, Lázaro C, Gel B. Evaluation of CNV detection tools for NGS panel data in genetic diagnostics. Eur J Hum Genet. 2020 Dec;28(12):1645-1655. DOI: 10.1038/s41431-020-0675-z.
Gel B, Serra E. karyoploteR: an R/Bioconductor package to plot customizable genomes displaying arbitrary data. Bioinformatics. 2017 Oct 1;33(19):3088-3090. DOI: 10.1093/bioinformatics/btx346.
Información adicional
Redes colaborativas
European Reference Network (ERN) Genturis
A través del CSUR de Facomatosis HUGTiP-ICO-IGTP, el grupo forma parte de esta red de referencia europea, que conecta proveedores de atención sanitaria y centros de experticia en atención altamente especializada para pacientes con enfermedades genéticas que predisponen al cáncer.
CIBERONC
El grupo participa en el Centro de Investigación Biomédica en Red Cáncer (CIBERONC), asignado al grupo liderado por el Dr. Gabriel Capellá, dentro del Programa de Tumores del Tracto Digestivo.
Tesis doctorales
Title: Integrative genomic analyses of MPNST
Author: Miriam Magallon Lorenz
Supervisors: Bernat Gel, Eduard Serra
University: Universitat de Barcelona
Date of defense: July 2023
Noticias
El IGTP ofrece oportunidades de doctorado dentro de la convocatoria INPhINIT Incoming 2025 de la Fundación "la Caixa"
La Fundación "la Caixa" convoca 30 becas para investigadores e investigadoras de todas las nacionalidades que deseen cursar estudios oficiales de doctorado en disciplinas STEM en centros de investigación y unidades de excelencia de España y Portugal. El IGTP está abierto a acoger estudiantes dentro de este programa. Las personas seleccionadas podrán incorporarse a uno de los grupos de investigación del IGTP y desarrollar su investigación en el área de estudio de su interés.
Can Ruti abre sus puertas a estudiantes de Badalona por la Semana de la Ciencia
Cerca de 200 estudiantes de bachillerato y ciclos formativos de institutos de Badalona han visitado los centros del Campus Can Ruti. La actividad "Open House, conoce de cerca el Campus Can Ruti", organizada por el Servicio Educativo de Badalona y el Instituto de Investigación Germans Trias i Pujol (IGTP), en coordinación con las otras instituciones del Campus, se ha consolidado como una de las iniciativas destacadas de la Semana de la Ciencia.
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