Unidad de CitometríaServicio de Microcopía ElectrónicaUnidad de GenómicaUnidad de ProteómicaUnidad de CriobiologíaCentro de Modelos Experimentales
Unidad de Genética FuncionalUNIDAD DE HIBRIDACIÓN DE MICROMATRICES Y GENÉTICA FUNCIONAL
Las herramientas de base genómica de análisis masivo han supuesto un considerable avance tecnológico en el estudio de la relación gen-enfermedad similar al de la incorporación del microscopio o la PCR en los laboratorios clínicos y de investigación. A diferencia de los sistemas de análisis tradicionales, el estudio genético basado en las micromatrices implica la evaluación simultánea de miles de genes (>30.000) que se traducen en más de 100.000 proteínas y en un enorme número de interacciones gen-gen, proteína-gen y proteína-proteína. En cualquier caso, el análisis masivo de genes implica una nueva concepción de los diseños experimentales y una nueva forma de interpretar los resultados alcanzados. Con este objetivo se ha creado la Unidad de Hibridación de Micromatrices i Genética Funcional del Institut d’Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol para liderar proyectos pioneros e innovadores tanto en la vertiente científico-tecnológica como en la interpretación funcional de los resultados. Básicamente, con los equipos que disponemos en este momento se podrán hibridar y analizar muestras con distintas tecnologías de micromatriz en soporte de cristal. Mientras que para la interpretación funcional de los resultados intervendrán distintas plataformas bioinformáticas y de proteómica auspiciadas por la Fundación Genoma España, además de sistemas experimentales in vivo e in vitro.
- Diagnóstico molecular: cribado genético (resecuenciación), identificación de patógenos (detección de ADN patógeno), resistencia a fármacos (SNPs, análisis de expresión genética), diagnóstico y pronóstico (análisis de expresión genética).
- Farmacogenética y farmacogenómica: identificación de genes (resecuenciación, análisis de expresión genética, SNPs), respuesta a fármacos y diagnóstico predictivo (SNPs).
- Investigación y desarrollo de nuevos fármacos: cribado de fármacos (análisis de la expresión genética), diseño y estratificación de ensayos clínicos (SNPs).
- Determinación de perfiles de proteínas “multiplex” (análisis comparativo y de screening).
- Identificación en tejido de dianas FISH.
- QIAcube (IZASA, BCN, España): facilitará la extracción y purificación automatizada de RNA, DNA y proteínas de a partir una o de distintas muestras biológicas. Este equipo permitirá la estandarización y control de los distintos procesos claves para una buena reproducibilidad de la técnica de microarrays.
- Experion System (BIO-RAD Lab. S.A., USA): se trata de un sistema de electroforesis automático que permite mediante el microvolúmenes el análisis de la integridad y cuantificación de RNA, DNA y proteínas mediante chips específicas. Este equipo constituye un paso imprescindible para los posteriores procesos de hibridación con la ventaja sobre los sistemas convencionales que requieren más consumo de tiempo y muestra.
- TrayMix (BioTray, Francia): estación de hibridación automática con control informático que permite programar y estandarizar las distintas fases del procedimiento. Esta estación de hibridación se caracteriza por reducir el consumo de muestra y reactivos, así como los tiempos de la hibridación gracias a novedades tecnológica bajo patente de BioTray. En nuestro caso disponemos de 4 cámaras de hibridación independientes que también permiten el marcaje de tejidos in situ.
- Hybex (SciGene, USA): este hibridador manual constituye un complemento para la realización de múltiples micromatrices en un mismo soporte. Este equipo nos permite completar y flexibilizar la estación de trabajo respondiendo de forma más amplia a los arrays comercializados con distintas finalidades y formatos.
- InnoScan 700 (Innopsys, Francia): para la lectura de micromatrices disponemos de un escáner de alta resolución (3 micras), con dos láseres que permiten la lectura de dos longitudes de onda distintas de forma simultánea y enfoque confocal y automático. Este equipo esta complementado con un software (Mapix v.3.0, Innopsys) para el análisis de la imagen.