Fundació Institut d'Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol

UNITAT D’HIBRIDACIÓ DE MICROMATRIUS I GENÈTICA FUNCIONAL

Les eines de base genòmica d’anàlisi massiu han suposat un considerable avanç tecnològic en l’estudi de la relació gen-malaltia similar al de la incorporació del microscopi o la PCR en els laboratoris clínics i d’ investigació. A diferència dels sistemes d’anàlisi tradicionals, l’estudi genètic basat en les micromatrius implica l’avaluació simultània de milers de gens (>30.000) que es tradueixen en més de 100.000 proteïnes i en un immens número d’interaccions gen-gen, proteïna-gen i proteïna-proteïna. En qualsevol cas, l’anàlisi massiu de gens implica una nova concepció dels dissenys experimentals i una nova forma d’interpretar els resultats aconseguits. Amb aquest objectiu s’ha creat l’Unitat d’Hibridació de Micromatrius i Genètica Funcional de l’Institut d’Investigació en Ciències de la Salut Germans Trias i Pujol per liderar projectes pioners e innovadors tant en la vessant científico-tecnològica com interpretació funcional dels resultats. Bàsicament, amb els equips que disposem en aquest moment es podran hibridar i analitzar diferents tecnologies de micromatrius en suport de vidre. Mentre que per la interpretació funcional dels resultats intervindran diferents plataformes bioinformàtiques i de proteòmica patrocinades per la “Fundación Genoma España”, a més de sistemes experimentals in vivo i in vitro.

Capacitat:

Diagnòstic molecular: selecció genètica (re-seqüenciació), Identificació de patògens (detecció d’ADN patogen), resistència a fàrmacs (SNPs, anàlisi d’expressió genètica), diagnòstic i pronòstic (anàlisi d’expressió genètica).
Farmacogenètica i farmacogenòmica: identificació de gens (re-seqüenciació, anàlisi d’expressió genètica, SNPs), resposta a fàrmacs i diagnòstic predictiu (SNPs).
Recerca i desenvolupament de nous fàrmacs: selecció de fàrmacs (anàlisi de l’expressió genètica), disseny i estratificació d’assajos clínics (SNPs).
Determinació de perfils de proteïnes múltiplex (anàlisi comparatiu i de screening).
Identificació en teixit de dianes FISH.

Equips:

QIAcube (IZASA, BCN, Espanya): facilitarà l’extracció i purificació automatitzada de RNA, DNA i proteïnes de a partir d’una o de diferents mostres biològiques. Aquest equip permetrà l’estandardització i control dels diferents processos claus per una bona reproductibilitat de la tècnica de microarrays.
Experion System (BIO-RAD Lab. S.A., USA): és un sistema d’electroforesi automàtic que permet mitjançant microvolums l’anàlisi de la integritat i quantificació de RNA, DNA i proteïnes mitjançant xips específics. Aquest equip constitueix un pas imprescindible per els posteriors processos d’hibridació amb l’avantatge sobre els sistemes convencionals que requereixen de més consum de temps i mostra.
TrayMix (BioTray, França): estació d’hibridació automàtica amb control informàtic que permet programar i estandarditzar les diferents fases del procediment. Aquesta estació d’ hibridació es caracteritza per reduir el consum de mostra i reactius, així com els temps de la hibridació gràcies a novetats tecnològiques sota patent de BioTray. En el nostre cas disposem de quatre cambres d’hibridació independents que també permeten el marcatge de teixit in situ.
Hybex (SciGene, USA): aquest hibridador manual constitueix un complement per la realització de múltiples micromatrius en un mateix suport. Aquest equip ens permet completar i flexibilitzar l’estació de treball responent de forma més amplia als arrays comercialitzats amb diferents finalitats i formats.
InnoScan 700 (Innopsys, França): per la lectura de la micromatrius disposem d’un escàner d’alta resolució (3 µm), amb dos làsers que permeten la lectura de dues longituds d’onda diferents de forma simultània i enfocament confocal i automàtic. Aquest equip està complementat amb un software (Mapix v.3.0, Innopsys) per l’anàlisi de la imatge.